比较与进化基因组

每日paper - 20211217 - 蝙蝠、猫科动物、穿山甲

2021-12-17  本文已影响0人  阿芃

Cross-Species Transmission and Differential Fate of an Endogenous Retrovirus in Three Mammal Lineages

2015 年发表在 PLoS Pathog 上。通讯作者为犹他州大学医学院 Department of Human Genetics 的 Cedric Feschotte,第一作者为 Xiaoyu Zhuo。

脊椎动物基因组中内源性逆转录病毒非常常见,可以用来研究在很深的时间尺度里的逆转录病毒的演化。

研究者们基于已有的数据,研究了一种蝙蝠 Myotis lucifugus 中的逆转录病毒在其他哺乳动物中的渗透。多项证据证明了在蝙蝠、猫科动物和穿山甲之间跨目(ordinal)的丙型逆转录病毒的转移。在初次进入基因组后,ERV 在猫科动物和蝙蝠中都进行了大量的扩增,产生了数百个物种特异的插入。然而,ERV 在猫科动物和蝙蝠中经历的扩增动态过程是不一样的。在猫科动物中,ERV 是由单个前病毒祖先扩张而来,这个祖先在整合到基因组上之后很快就丢失了感染的能力;而在蝙蝠中,ERV 的演化历程更为复杂,除了转座扩增之外,还存在多次感染事件。结果也表明蝙蝠中的一些 ERV 很长时间都保持着感染能力,现在可能也仍然有感染的能力。

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