R数据处理R语言

R四大高效编程神器——apply家族

2022-07-24  本文已影响0人  Bio_Infor

本节提要:

  • apply()函数
  • sapply()函数
  • lapply()函数
  • tapply()函数

熟悉R编程的人都知道R语言的apply家族,而R语言入门容易,简单学一学就能写出一些代码,而良好的编程习惯和优雅的代码风格却是一个长期潜移默化、逐步积累的过程。

R语言的apply家族正是为你高效编程提供了可能性,其令人惊讶的处理方式可能会成为你选择它们的理由。

apply()

要点:

apply()函数能够快速帮助你对数据框或矩阵按行(MARGIN = 1)或列(MARGIN = 2)的方式来进行处理,而这个处理正是由FUN所定义的。

示例:
#a matrix
mtx <- matrix(1:9, byrow = T, nrow = 3)
mtx
#     [,1] [,2] [,3]
#[1,]    1    2    3
#[2,]    4    5    6
#[3,]    7    8    9
apply(X = mtx, 
      MARGIN = 1, #by row
      FUN = mean) #cal mean value (mean function)
#[1] 2 5 8

这段代码实现了对该矩阵按行取均值的操作,最后返回一个向量,分别对应每一行的均值,当然你也可以自定义函数,例如还是上面的目的,用自己写的函数来实现(当然这完全没必要):

apply(X = mtx, 
      MARGIN = 1, #by row
      FUN = function(x){
        sum(x)/length(x)
      }) #cal mean value (custome function)

想给大家分享的是,这段代码里面的x到底是个什么?答案是 向量。也就是说 apply()函数讲数据框或矩阵给你拆成了一个个向量供你进行操作,我们来简单验证一下:

apply(X = mtx, 
      MARGIN = 1, #by row
      FUN = function(x){
        is.vector(x)
      })
#[1] TRUE TRUE TRUE

sapply()

要点:

从本质上看,R语言的数据框是一种特殊的列表(每个组件长度都相等的列表)。这个组件就是数据框的每一列,由于数据框的特点,这些组件的类型是不一样的,有的是字符型向量,有的是数值型向量等等。

首先来看sapply()函数是如何处理列表的:

#a list
list <- list(a = sample(1:10, 5),
             b = 1:5)
list
#$a
#[1] 4 6 8 1 5
#$b
#[1] 1 2 3 4 5
sapply(list, FUN = sum)
# a  b 
#24 15 

最终是对列表的每个组件进行了函数(sum())的操作,返回了一个向量。

基于前面对数据框和列表之间联系的认识,我们很自然的就可以知道,如果将sapply()函数作用到数据框上会发生什么:对数据框的每一列进行相应的操作:

#a dataframe
dataframe <- data.frame(a = sample(1:10, 5),
                        b = 1:5)
dataframe
#   a b
#1  2 1
#2  9 2
#3 10 3
#4  5 4
#5  6 5
sapply(dataframe, FUN = sum)
# a  b 
#32 15 

果然是对数据框的每一列进行了求和。

lapply()

要点:

lapply()sapply()函数很像,不同点在于前者的输出是列表,这在很多时候会给我们带来一些意想不到的便利。暂时只做一个简单的使用示例:

list <- list(a = sample(1:10, 5),
             b = 1:5)
list
lapply(list, FUN = sum)
#$a
#[1] 38
#$b
#[1] 15

tapply()

要点:

tapply()函数在进行分组统计时具有非常大的作用,简单理解来说,tapply()函数就是对向量X按照因子INDEX进行函数FUN的操作。这里我们以鸢尾花内置数据集为例来看看:

head(iris)
#  Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
#1          5.1         3.5          1.4         0.2  setosa
#2          4.9         3.0          1.4         0.2  setosa
#3          4.7         3.2          1.3         0.2  setosa
#4          4.6         3.1          1.5         0.2  setosa
#5          5.0         3.6          1.4         0.2  setosa
#6          5.4         3.9          1.7         0.4  setosa
#calculate mean Sepal length for each species
tapply(iris$Sepal.Length, 
       INDEX = factor(iris$Species), #group by species
       FUN = mean) #calculate mean value
#    setosa versicolor  virginica 
#     5.006      5.936      6.588

这实际上和dplyrgroup_by()很像,也就是说这个功能还可以用这段代码实现:

library(dplyr)
iris %>% 
  group_by(Species) %>% 
  summarise(mean = mean(Sepal.Length))

不过返回的是数据框罢了。

上一篇下一篇

猜你喜欢

热点阅读