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利用R快速下载和筛选GBIF物种分布数据:

2022-06-09  本文已影响0人  生信小窝

利用R快速下载和筛选GBIF物种分布数据:

示例物种:银杏Ginkgobiloba L.

首先,我们在GBIF官网(https://www.gbif.org/)搜索了物种银杏(Ginkgo biloba L.)的分布数据,发现有几千条数据,如果用官网的下载和复制方式会出现乱码和下载缓慢的问题,偶尔网页会奔溃,手动复制过程中极易出错。我们采用R下载数据,可以在几十秒内下载成千上万条数据,并完成自动筛选获得有效分布数据,获得的数据信息也非常完善,包含了ID编号、经纬度、国家、采集日期、作者、参考文献资料等五十余条信息。

以下是利用R获取的银杏(Ginkgo biloba L.)的分布数据,软件一键自动下载并筛选获得了475条有效的分布数据,自动过滤掉了无效的数据信息。

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