2019-05-02从NCBI SRA下载数据

1.wget 方法

ftp://ftp-trace.ncbi.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR207/SRR2078288/SRR2078288.sra

修改后面三项

点击all runs 获取 SRR号

wget -c 修改后的连接

但是速度很慢，一条一条输入

参考： 手把手教你如何下载SRA数

centos 如何去掉锁屏功能CentOS取消屏幕保护自动锁屏功能 - Catherine的笔记 - CSDN博客

2. 如何批量下载

3.

ps -ef | grep prefe 查看后台prefe的命令

ps -ef | grep prefe | awk 'print $2'|while read id ; do kill $id;done

grep failed raw/nohup.out

zless -SN SRR.fastq.gz

ls *gz | xargs fastqc -t 10

multiqc ./ 合并fastqc