生信星球培训第八十七期

DAY4-谢荣俊

2020-11-02  本文已影响0人  谢荣俊

今天开始学R语言了,一步一步走来,一天一天打卡,感觉有人监督和交作业的感觉比较好,可能懒惰是一种习惯吧,得治啊。


生信星球学习小组第87期DAY4-R语言基础 思维导图 谢荣俊

一、查看电脑用户名是中文还是英文:


是中文的话需要修改,避免中文用户名引起的莫名其妙的报错。具体操作参考:当Rstudio杠上中文用户名 生信星球


二、安装R和Rstudio:


具体操作参考:

  1. 给自己一个全新的R语言环境 果子学生信
  2. 史上最贴心R包安装示范视频 生信技能树

三、认识R和Rstudio:


R是一种编程语言,也是统计计算和绘图的环境,它汇集了许多函数,能够提供强大的功能。
R语言软件界面简陋,通常不直接使用,而是用图形界面的Rstudio。Rstudio是免费提供的开源集成开发环境(IDE)。RStudio提供了一个具有很多功能的环境,使R更容易使用,是在终端中使用R的绝佳选择。


四、熟悉Rstudio的工作界面:

Rstudio的工作界面 生信星球

五、学会Rstudio外观设置和基本操作:


  1. 设置字体大小。
  2. 设置镜像网站。
  3. 设置R版本。

六、R语言基本操作


  1. 用Rproject管理工作目录:设置工作目录:setwd()。查看工作目录:getwd()。如果只设置了一个工作目录。当多个项目并行的话,全都在一个文件夹下,会显得比较乱。具体操作参考:R-project管理多个R工作目录 生信星球
  2. 显示文件目录:dir(),list.files()。
  3. 加减乘除及其他运算:注意一些特殊运算的表达方式。
  4. 赋值:赋值符号用<-,就是小于号加上减号,也可以按Alt加上减号。
  5. 删除变量:rm(变量名称),rm(变量名称1,变量名称2), rm(list = ls()) 清空所有变量。要注意括号要是英文的。
  6. 列出历史命令:history() ,相当于鼠标单击右上角的history标签。
  7. 清空控制台:ctrl+l。

七、尝试用R做简单的图:


  1. 涉及到的函数和数据集:
    1.1 rnorm()函数产生一系列的随机数,随机数个数,均值和标准差都可以设定。具体参考: R语言-rnorm函数 博客园
    1.2 plot()函数是R中的基本画图工具,直接plot(x),x为一个数据集,就能画出图。具体参考:R---plot()参数详解 简书R语言plot函数参数合集 博客园
    1.3 boxplot()函数用于创建盒形图。具体参考:R语言盒形图(箱形图)易百教程
    1.4 runif()函数用来取随机数。具体参考:R语言函数的使用技巧及随机数 简书
    1.5 iris数据集(鸢尾属植物数据集):它首次出现在著名的英国统计学家和生物学家Ronald Fisher 1936年的论文《The use of multiple measurements in taxonomic problems》中,被用来介绍线性判别式分析。在这个数据集中,包括了三类不同的鸢尾属植物:Iris Setosa,Iris Versicolour,Iris Virginica。每类收集了50个样本,因此这个数据集一共包含了150个样本。R自带,在R提示符下输入iris回车可看到内容。
  2. 实操图片:


    使用plot()函数对rnorm()函数生成的50个随机数做散点图
    使用boxplot()函数对iris数据集做箱式图
    查看R自带的iris数据集
    查看R自带的iris数据集
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