生物信息学

科研新热点——血管生成相关基因

2022-07-17  本文已影响0人  生信交流平台

前面小编给大家分享了几个科研中经常用到的基因集,以及如何使用这些基因集进行相关分析。

m6A甲基化相关基因集

铁死亡相关基因集

SCI文章中经常出现的免疫相关基因集

基本套路都是先做差异表达分析,然后跟这些热点的基因集取个交集,然后再做后续分析。例如针对这些基因进行单因素,多因素cox回归,lasso回归,寻找显著跟生存相关的基因,然后构建风险评估模型。

一个R函数搞定风险评估散点图,热图

今天小编来给大家分享一个最近比较火爆的基因集合,血管生成相关基因。

下面这篇文章2022年2月22日发表在frontiers in immunology杂志上,研究了血管生成相关的基因在胃癌中的作用。

作为一篇纯生信类的文章,能够发表在影响因子7.6分杂志上,这个思路值得大家学习。

可以看到作者一上来就看了血管生成相关的基因在胃癌中的差异表达情况。

这个图相信大家在很多文章里都见过,前面在讲免疫相关基因集的时候,很多文章里面也有类似的图。

具体绘制的方法小编在讲m6A甲基化相关的基因集时,就给大家分享过。

m6a甲基化相关基因boxplot并显示p值

或者看这个基因集里面的基因是否跟临床信息相关

m6a甲基化相关基因根据临床信息分组绘制boxplot并显示p值

为了方便大家紧跟科研热点,今天小编就将这篇文章中用到的36个血管生成相关的基因整理分享给大家。

完整血管生成相关基因列表如下

科研新热点——血管生成相关基因

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