ggplot2作图共享图例方法一:ggpubr包的ggarran
image.png当使用ggplot2作图的时候如果多个图拼接到一起,图例互相之间有一样的时候,比如如下的情况(我们用R语言内置的鸢尾花的数据集做三个散点图)
实现上面图片的代码是
library(ggplot2)
library(ggpubr)
df<-iris
colnames(df)<-paste0("V",1:5)
p1<-ggplot(df,aes(x=V1,y=V2))+
geom_point(aes(color=V5))+
theme_bw()
p2<-ggplot(df,aes(x=V1,y=V3))+
geom_point(aes(color=V5))+
theme_bw()
p3<-ggplot(df,aes(x=V1,y=V4))+
geom_point(aes(color=V5))+
theme_bw()
ggarrange(p1,p2,p3,ncol = 3)
因为三个图的图例是一样的,我们完全可以只显示一个图例就够了。
这里拼图使用的函数是ggpubr
这个包里的ggarrange()
函数,这个函数里有一个参数是common.legend
,默认好像是FALSE,我们直接设置成TRUE就好了,代码如下
ggarrange(p1,p2,p3,ncol = 3,
common.legend = T)
image.png
还有一个legend
参数用来控制图例的位置
ggarrange(p1,p2,p3,ncol = 3,
common.legend = T,
legend = "right")
image.png
还有一种情况是分组过多如何调整图例的布局,比如
代码
df$V6<-sample(LETTERS[1:6],150,replace = T)
p4<-ggplot(df,aes(x=V1,y=V2))+
geom_point(aes(color=V6))+
theme_bw()
p5<-ggplot(df,aes(x=V1,y=V3))+
geom_point(aes(color=V6))+
theme_bw()
p6<-ggplot(df,aes(x=V1,y=V4))+
geom_point(aes(color=V6))+
theme_bw()
ggarrange(p4,p5,p6,ncol = 3,
common.legend = T)
结果是
image.png图例放到顶部,默认的布局是3行3列,如果要改成1行6列呢?ggplot2里应该有对应的参数可以修改吧?但是目前还不知道如何使用ggplot2自带的函数来操作,查资料的时候发现了一个R包
lemon
里有一个reposition_legend()
函数
参考资料的链接是
https://cran.r-project.org/web/packages/lemon/vignettes/legends.html
但是我按照这个方法操作我自己的数据的时候一直遇到报错
代码是
#install.packages("lemon")
library(lemon)
reposition_legend(p4,panel = c('panel-1-5'),position = "top")
报错内容是
Error in reposition_legend(p4, panel = c("panel-1-5"), position = "top") :
Could not find panel named `panel-1-5`.
暂时还没有搞懂是什么原
我去查了一下ggplo2里关于图例的布局,找到了解决办法
参考链接是
https://ggplot2.tidyverse.org/reference/guide_legend.html
如果将ggplot2的图例设置为顶部,默认结果如下
p4<-ggplot(df,aes(x=V1,y=V2))+
geom_point(aes(color=V6))+
theme_bw()+
theme(legend.position = "top")
p4
image.png
图例两行,顺序是从上到下依次排,那如果要改成2行从左到右依次排列呢?
p4<-ggplot(df,aes(x=V1,y=V2))+
geom_point(aes(color=V6))+
theme_bw()+
theme(legend.position = "top")+
scale_color_discrete(
guide=guide_legend(byrow = T)
)
p4
image.png
如果要改成一行的话再加一个nrow参数就好了
p4<-ggplot(df,aes(x=V1,y=V2))+
geom_point(aes(color=V6))+
theme_bw()+
theme(legend.position = "top")+
scale_color_discrete(
guide=guide_legend(byrow = T,nrow = 1)
)
p4
image.png
欢迎大家关注我的公众号
小明的数据分析笔记本
小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子;2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记;3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记!