免疫组化IPP分析

2017-06-05  本文已影响0人  飞扬青春001

背景

1.图片来源。DAB显色的免疫组化图片

2.输出的结果。

统计用的结果是density(mean)

3.光密度(OD)反映蛋白的量。

灰度值:黑0----白255。

步骤

1.光密度校正。具体步骤很容易查到。

2.设置测量参数。 area 和IOD

面积过滤值=100

显示选项中:

 NO fill holes, smooth=2, 

选area 和IOD


如图设置

3.保存测量环境文件

4.手工描绘测量区域

5.选择色彩。选择HSI

H:0-29

S:不动

I:MAX=光密度校正的背景值相同(靠近255一端)

根据图片的显色,可以适当微调HSI

最后保存选色文件。file-save-

6.设置数据收集器

image----name

count/size----area(---sum) and  IOD(---sum)

7.测量

测量选择区域面积:edit-count aoi to objects

在data collector中读取测量数据

然后,delete 测量

重新点AOI自主描绘窗口工具,之前画的框就会自动出现

点击count---在data collector中读取测量数据

小IOD除以大Area.=平均光密度值

8.数据整理

同一样品不同视野的结果取均值=一份样品的结果

同一处理组的不同样品的结果进行统计分析。

注意事项

1.图片的拍摄条件不能变。相同光亮,相同放大倍数,相同曝光条件。

2.不能使用自动拍照功能,必须手动拍照。

3.曝光条件。将空白区域调整到视野中央,通过曝光,使灰度值在230左右,然后校正白平衡,使它显示纯白色。

资料来源链接:免疫组化Image pro plus


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