单细胞

思路清奇SCI:05.ssGSEA+41条代谢通路

2021-04-29  本文已影响0人  高大石头

PMID: 33324566

路线图

结果

1.ssGSEA分析代谢通路+PAM聚类

作者从MSigDB和KEGG收集了41条代谢相关通路,ssGSEA计算各个样本的评分,对ssGSEA用PAM方法聚类。


Fig 2

2.聚类结果周边

Fig 3
Fig 4
Fig 5

3.WGCNA确定核心基因

Fig 6

4.模型构建

Fig 7

5.药物敏感性+免疫反应

Fig 9

备注:

  1. 前列腺癌总体生存期较好,目前主要预测的是无复发生存期(disease-free survival,DFS)

    2.肿瘤不只有预后分析,诊断的作用同样重要。

    参考文献:
    Identification of Metabolism-Associated Prostate Cancer Subtypes and Construction of a Prognostic Risk Model
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