2021-07-11 U1 snRNA的非剪接功能-2

        之前我们介绍了一种U1 snRNA的非剪接功能——通过与lncRNA互作调控这些lncRNA在染色质上的定位，进而影响基因转录。今天分享的是同一个课题组分别在2010年发表在Nature上和2012年发表在Cell上的关于U1 snRNA的非剪接功能——抑制pre-mRNA的过早切割与加多聚腺苷尾（premature cleavage and polyadenylation，PCPA），从而起到调节mRNA长度的目的。

U1 snRNP介导的PCPA

三言两语

1.在2010年发表在Nature的文章中，研究者使用AMO（antisense morpholino oligonucleotide，反义吗啉环寡核苷酸，一种可以靶向RNA，但不诱导RNA切割的反义核酸，可以实现对RNA的封闭，阻止靶标RNA与其他分子的结合）靶向U1，发现除了抑制RNA剪接外，还会导致一些RNA出现PCPA。进一步分析发现，在基因的intron中也常常存在多聚腺苷化加尾信号（AAUAAA），而U1 snRNA则可以通过与intron 中AAUAAA序列互作阻止其作为多聚腺苷化的信号及其介导的RNA切割与多聚腺苷化加尾。

2.在2012年发表在Cell上的研究中，研究者开发用于检测不同转录本的HIDE-seq技术，并且在中等强度抑制U1 snRNA的情况下，通过HIDE-seq检测mRNA的转录本发现，mRNA会因为PCPA的抑制解除而产生不同长度的变体。

Reference

1.Kaida, D. et al. U1 snRNP protects pre-mRNAs from premature cleavage and polyadenylation. Nature 468, 664-668 (2010).

2.Berg, M. G. et al. U1 snRNP determines mRNA length and regulates isoform expression. Cell 150, 53-64 (2012).

3.Merkhofer, E. C. & Johnson, T. L. U1 snRNA rewrites the "script". Cell 150, 9-11 (2012).