R学习与可视化群体遗传学绘图技巧

iTOL 注释文件

2021-07-05  本文已影响0人  斩毛毛

利用iTOL 进行批量添加颜色

1 下载实例文件

进入官网(https://itol.embl.de),依次点击help--> help pages-->tree annotation

实例文件下载
## 数据分割类型;有COMMA, SPACE, TAB
SEPARATOR TAB

## DATA 下面输入正式数据;一般为
label; value ...

2. 简单例子

比如, 不同label, clade 给定不同颜色
可以查看 colors_tol.txt

TREE_COLORS
SEPARATOR TAB
DATA
## 树上的标签,对应不同部分,颜色,格式,大小
777 clade   #c04104 normal  1
I132    clade   #0c4e99 normal  1
187410  clade   #8c6d63 normal  1
I65 clade   #e41ea4 normal  1
I141    clade   #c23551 normal  1
I12 clade   #a16088 normal  1
I57 clade   #02165d dashed  1
I49 clade   #8a3861 dashed  1
I74 clade   #cabd33 dashed  1
777 label   #fcea84 bold-italic 2.6
65699   label   #9c38e7     0.3
491 label   #564642 italic  1.7
536 label   #91332f     0
520 label   #ea09e4 bold    2.7
519 label   #f27403 bold    3
518 label   #2e955d     0.9
305 label   #d35bf7 bold-italic 1.2
915 label   #2b4df3 bold    2.8
181661  label   #709cb8 bold-italic 3

可以将上述文件直接拖入Tree of Life 中的树进行查看
修改之前的树


修改前 修改后
上一篇下一篇

猜你喜欢

热点阅读