如何将样品名添加到contig名称的开头位置
2022-12-15 本文已影响0人
田小田_8afd
需要将样品名称添加到contig 名称的前面，用"__"分隔，并删除序列的长度及其他信息，可采用如下方法：
sed '/^>/s/k/SRR1035_k/' | awk -F '[ ]' '{print $1} > SRRSRR1035.contig.fasta'
注解如下：
但是目前仅实现了单个文件的替换，下一步摸索采用循环替换。自学的路是道阻且长，加油吧！
需要将样品名称添加到contig 名称的前面，用"__"分隔，并删除序列的长度及其他信息，可采用如下方法：
sed '/^>/s/k/SRR1035_k/' | awk -F '[ ]' '{print $1} > SRRSRR1035.contig.fasta'
注解如下：
但是目前仅实现了单个文件的替换，下一步摸索采用循环替换。自学的路是道阻且长，加油吧！
