在NCBI上上传叶绿体基因组
2022-07-26 本文已影响0人
路人里的路人
Bankit(也可使用该项上传trnl-F序列)
在使用Bankit上传叶绿体基因组时还需要准备一些前提文件:
第一个:拼接好的叶绿体基因组文件(具体方法:)
第二个:物种的fasta与TBL文件(具体方法:)
打开NCBI官网,进入Bankit(官网:BankIt (nih.gov)),点击Start Bankit Submission,开始上传。
共有八个步骤,具体操作如下:
第一步contact,该步主要是确认上传者的信息,以前已经填写好了直接continue.
第二步Reference,主要是填写自己的名字,填写后continue.
第三步sequencing techoligy,填写内容如下图。
图一第四步Nucleotide,填写要求如下。若是叶绿体基因组则选择immediately after processiing,Trnl-f则可以指定释放日期,叶绿体的topology选circular,trnl-f选Linear,设置好后点continue.
图二