让我看看，是哪个软件可以让Venn Plot 和 Upset P

前段时间，科研所需，学习了一下Venn图的绘制。一方面看了看Tbtools上的相关绘图功能，另一方面也了解了一下别人对于Venn图的理解和应用，这篇文章主要说说我个人认为比较有用的部分，和你们分享哈。

1. Venn plot 和 Upset plot 的关系？

Venn Plot 韦恩图，在不太严格的意义下用以表示 集合关系 的一种草图。这里的集合，没错，就是我们高中学的集合。

集合数 ≤ 4使用 Venn Plot 可视性强 （TBtools绘制） 

然而当集合数量变多，你的Venn图就会变成：

看起来稍显凌乱，not very well（TBtools绘制） 

Upset Plot 韦恩图进阶版，可以很好地展示多个集合（≥5个）之间的关系。

集合数＞4 时 Upset Plot 则是最佳选择（TBtools绘制）

2. TBtools上相关功能如何使用？

有这三个功能

功能1，支持2-6组的set绘制韦恩图，文件可直接拖拽，适用于2-4个set的情况，5或6就可以，就是不太好看。

准备数据 一秒出图

功能2和3都是 upset plot，唯一的区别就是up to any set是逐个添加集合，类似于1添加文件的过程；而3则是batch，就是批量，可一口气拖拽所有文件。导入文件后，还是直接开始即可。

2界面 3界面

至于如何解读Upset Plot，盯着你的结果图5分钟，仔细思考，我觉得你会明白的。

这里，如果你想利用Upset包绘图，可以直奔 https://blog.csdn.net/tuanzide5233/article/details/83109527

3. 或许 Venn 和 Upset 可以结合一下？ 

在了解别人是如何画韦恩图的时候，看到这样一句话： upset plot唯一的槽点是空白的地方太多。看了看，确实是，于是人家提出，或许可以将二者结合？

内容会更丰富，且毫无违和感

原文见：http://www.360doc.com/content/18/0810/14/33037066_777220390.shtml

并且这里面非对称的venn图让我很感兴趣，于是我找到了这个这个软件：http://sysbio.uni-ulm.de/?Software:VennMaster

如果你也需要这个软件，首先下载安装方法在主页说的非常清楚了，打开软件之后，针对咱们之前为Tbtools准备的文件，可以打开这个选项，同时打开几个集合，就会得到下图。在图片上右键可以修改颜色，添加一些标签等，自己点点试试，一目了然。

打开这个选项 针对你想添加label的地方右键，进行一些设置

总之，用TBtools出图无疑是方便快捷的，尤其是在set数比较少的时候，可以说是首选。当你的样本量较大，有更多的需求时，或者可以尝试写写代码，用用其他软件丰富你的结果哈。

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今日份鸡汤：功不唐捐，玉汝于成，每天再多努力一点点吧！