3.基于表观和转录组进行多组学WGCNA分析确定胃肠型糖尿病中的

题目: Identification of hub‐methylated differentially expressed genes in patients with gestational diabetes mellitus by multi‐omic WGCNA basing epigenome‐wide and transcriptome‐wide profiling

DOI: 10.1002/jcb.29584

数据来源: GEO: GSE70493；GSE70494

样本:

GSE70493：mRNA数据，32GDM和31对照
GSE70494：82个DNA甲基化数据，41GDM和41对照

分析方法:

WGCNA: 使用GSE70493中前25%变异数据分析
Cytoscape-ClueGo: 富集分析
GEO2R：GEO在线分析工具分析差异基因和差异甲基化基因
PCR: 来自10GDM和10对照的胎盘进行验证
GSEA富集分析: 根据基因表达量（平均表达量）区分低表达和高表达-单基因GSEA分析

文章数据：

1.分析流程图（比较关注如何和甲基化结合起来）
2.WGCNA分析结果（β值取7-未达到0.8，黑色模块与GDM相关-相关性-0.28）
3.黑色模块富集分析结果

4.hub基因、差异基因、差异甲基化基因 []
5.验证结果

6.GSEA分析结果

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