conda踩坑总结
2021-06-08 本文已影响0人
小狼小狼_e211
深呼吸，捋一遍
conda安装软件与环境管理 - 简书 (jianshu.com)
另外这篇分享帮大忙了，谢谢原作者
第一步，换回官方源
(base) vip9t07@tpm9-desktop:~$ vim ~/.condarc
(base) vip9t07@tpm9-desktop:~$ conda config --show channels
channels:
- https://repo.anaconda.com/pkgs/free/linux-64/
- https://repo.anaconda.com/pkgs/main/linux-64/
- defaults
- https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
- https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
- https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main
- https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free
第二步，更新base环境
(base) vip9t07@tpm9-desktop:~$ conda update -n base conda
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: done
## Package Plan ##
environment location: /home/data/vip9t07/miniconda3
added / updated specs:
- conda
The following packages will be downloaded:
package | build
---------------------------|-----------------
asn1crypto-0.22.0 | py36_0 148 KB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
certifi-2021.5.30 | py36h06a4308_0 139 KB defaults
cffi-1.10.0 | py36_0 341 KB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
chardet-3.0.4 | py36_0 190 KB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
conda-4.10.1 | py36h06a4308_1 2.9 MB defaults
conda-package-handling-1.7.3| py36h27cfd23_1 882 KB defaults
cryptography-1.8.1 | py36_0 846 KB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
idna-2.6 | py36_0 122 KB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
libffi-3.2.1 | 1 38 KB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
openssl-1.0.2l | 0 3.2 MB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
packaging-16.8 | py36_0 30 KB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
pip-9.0.1 | py36_1 1.7 MB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
pycparser-2.18 | py36_0 167 KB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
pyopenssl-17.0.0 | py36_0 76 KB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
pyparsing-2.2.0 | py36_0 96 KB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
pysocks-1.6.6 | py36_0 20 KB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
readline-6.2 | 2 606 KB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
requests-2.25.1 | pyhd3eb1b0_0 52 KB defaults
ruamel_yaml-0.11.14 | py36_1 401 KB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
setuptools-36.4.0 | py36_1 563 KB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
six-1.10.0 | py36_0 19 KB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
sqlite-3.13.0 | 0 4.0 MB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
tk-8.5.18 | 0 1.9 MB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
tqdm-4.15.0 | py36_0 48 KB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
urllib3-1.21.1 | py36_0 153 KB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
wheel-0.29.0 | py36_0 88 KB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
xz-5.2.3 | 0 667 KB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
yaml-0.1.6 | 0 246 KB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
zlib-1.2.11 | 0 109 KB https://repo.anaconda.com/pkgs/free
------------------------------------------------------------
Total: 19.5 MB
The following packages will be UPDATED:
certifi anaconda/cloud/conda-forge::certifi-2~ --> pkgs/main::certifi-2021.5.30-py36h06a4308_0
conda anaconda/cloud/conda-forge::conda-4.1~ --> pkgs/main::conda-4.10.1-py36h06a4308_1
conda-package-han~ anaconda/cloud/conda-forge::conda-pac~ --> pkgs/main::conda-package-handling-1.7.3-py36h27cfd23_1
The following packages will be SUPERSEDED by a higher-priority channel:
asn1crypto anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
cffi anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
chardet anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
cryptography anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
idna anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
libffi anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
openssl anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
packaging anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
pip anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
pycparser anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
pyopenssl anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
pyparsing anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
pysocks anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
readline anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
requests anaconda/cloud/conda-forge::requests-~ --> pkgs/main::requests-2.25.1-pyhd3eb1b0_0
ruamel_yaml anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
setuptools anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
six anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
sqlite anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
tk anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
tqdm anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
urllib3 anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
wheel anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
xz anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
yaml anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
zlib anaconda/pkgs/free --> pkgs/free
Proceed ([y]/n)? y
Downloading and Extracting Packages
cffi-1.10.0 | 341 KB | ################################################################################################################# | 100%
cryptography-1.8.1 | 846 KB | ################################################################################################################# | 100%
xz-5.2.3 | 667 KB | ################################################################################################################# | 100%
pysocks-1.6.6 | 20 KB | ################################################################################################################# | 100%
packaging-16.8 | 30 KB | ################################################################################################################# | 100%
pyparsing-2.2.0 | 96 KB | ################################################################################################################# | 100%
pyopenssl-17.0.0 | 76 KB | ################################################################################################################# | 100%
sqlite-3.13.0 | 4.0 MB | ################################################################################################################# | 100%
yaml-0.1.6 | 246 KB | ################################################################################################################# | 100%
ruamel_yaml-0.11.14 | 401 KB | ################################################################################################################# | 100%
readline-6.2 | 606 KB | ################################################################################################################# | 100%
conda-package-handli | 882 KB | ################################################################################################################# | 100%
asn1crypto-0.22.0 | 148 KB | ################################################################################################################# | 100%
pycparser-2.18 | 167 KB | ################################################################################################################# | 100%
wheel-0.29.0 | 88 KB | ################################################################################################################# | 100%
requests-2.25.1 | 52 KB | ################################################################################################################# | 100%
tk-8.5.18 | 1.9 MB | ################################################################################################################# | 100%
chardet-3.0.4 | 190 KB | ################################################################################################################# | 100%
certifi-2021.5.30 | 139 KB | ################################################################################################################# | 100%
conda-4.10.1 | 2.9 MB | ################################################################################################################# | 100%
tqdm-4.15.0 | 48 KB | ################################################################################################################# | 100%
idna-2.6 | 122 KB | ################################################################################################################# | 100%
urllib3-1.21.1 | 153 KB | ################################################################################################################# | 100%
openssl-1.0.2l | 3.2 MB | ################################################################################################################# | 100%
six-1.10.0 | 19 KB | ################################################################################################################# | 100%
zlib-1.2.11 | 109 KB | ################################################################################################################# | 100%
pip-9.0.1 | 1.7 MB | ################################################################################################################# | 100%
libffi-3.2.1 | 38 KB | ################################################################################################################# | 100%
setuptools-36.4.0 | 563 KB | ################################################################################################################# | 100%
Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done
第三步，灵活设置优先级
(base) vip9t07@tpm9-desktop:~$ conda config --set channel_priority flexible
第四步，确定要装的软件和哪个版本的python适配,创建环境
(base) vip9t07@tpm9-desktop:~$ conda create -n py38 deeptools=3.5.0 python=3
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: failed with repodata from current_repodata.json, will retry with next repodata source.
Collecting package metadata (repodata.json): done
Solving environment: done
## Package Plan ##
environment location: /home/data/vip9t07/miniconda3/envs/py38
added / updated specs:
- deeptools=3.5.0
- python=3
The following packages will be downloaded:
package | build
---------------------------|-----------------
blas-1.0 | mkl 6 KB defaults
bzip2-1.0.8 | h7b6447c_0 78 KB defaults
certifi-2021.5.30 | py37h06a4308_0 139 KB defaults
curl-7.71.1 | hbc83047_1 140 KB defaults
cycler-0.10.0 | py37_0 13 KB defaults
deeptools-3.5.0 | py_0 143 KB https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
deeptoolsintervals-0.1.9 | py37h516909a_0 72 KB https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
freetype-2.10.4 | h5ab3b9f_0 596 KB defaults
intel-openmp-2021.2.0 | h06a4308_610 1.3 MB defaults
jpeg-9b | h024ee3a_2 214 KB defaults
kiwisolver-1.3.1 | py37h2531618_0 80 KB defaults
krb5-1.18.2 | h173b8e3_0 1.3 MB defaults
lcms2-2.12 | h3be6417_0 312 KB defaults
libcurl-7.71.1 | h20c2e04_1 305 KB defaults
libedit-3.1.20210216 | h27cfd23_1 167 KB defaults
libgfortran-ng-7.3.0 | hdf63c60_0 1006 KB defaults
libpng-1.6.37 | hbc83047_0 278 KB defaults
libssh2-1.9.0 | h1ba5d50_1 269 KB defaults
libtiff-4.2.0 | h85742a9_0 502 KB defaults
libwebp-base-1.2.0 | h27cfd23_0 437 KB defaults
lz4-c-1.9.3 | h2531618_0 186 KB defaults
matplotlib-base-3.3.4 | py37h62a2d02_0 5.1 MB defaults
mkl-2021.2.0 | h06a4308_296 144.3 MB defaults
mkl-service-2.3.0 | py37h27cfd23_1 55 KB defaults
mkl_fft-1.3.0 | py37h42c9631_2 170 KB defaults
mkl_random-1.2.1 | py37ha9443f7_2 287 KB defaults
numpy-1.20.2 | py37h2d18471_0 23 KB defaults
numpy-base-1.20.2 | py37hfae3a4d_0 4.5 MB defaults
olefile-0.46 | py37_0 50 KB defaults
pillow-8.2.0 | py37he98fc37_0 622 KB defaults
pip-21.1.1 | py37h06a4308_0 1.8 MB defaults
plotly-4.14.3 | pyhd3eb1b0_0 3.6 MB defaults
py2bit-0.3.0 | py37h14c3975_2 22 KB https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
pybigwig-0.3.17 | py37hc013797_0 77 KB https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
pyparsing-2.4.7 | pyhd3eb1b0_0 59 KB defaults
pysam-0.15.3 | py37hda2845c_1 2.5 MB https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
python-3.7.10 | hdb3f193_0 45.2 MB defaults
python-dateutil-2.8.1 | pyhd3eb1b0_0 221 KB defaults
retrying-1.3.3 | py37_2 16 KB defaults
scipy-1.6.2 | py37had2a1c9_1 15.5 MB defaults
setuptools-52.0.0 | py37h06a4308_0 710 KB defaults
six-1.15.0 | py37h06a4308_0 27 KB defaults
tornado-6.1 | py37h27cfd23_0 589 KB defaults
zstd-1.4.9 | haebb681_0 480 KB defaults
------------------------------------------------------------
Total: 233.2 MB
The following NEW packages will be INSTALLED:
_libgcc_mutex pkgs/main/linux-64::_libgcc_mutex-0.1-main
blas pkgs/main/linux-64::blas-1.0-mkl
bzip2 pkgs/main/linux-64::bzip2-1.0.8-h7b6447c_0
ca-certificates pkgs/main/linux-64::ca-certificates-2021.5.25-h06a4308_1
certifi pkgs/main/linux-64::certifi-2021.5.30-py37h06a4308_0
curl pkgs/main/linux-64::curl-7.71.1-hbc83047_1
cycler pkgs/main/linux-64::cycler-0.10.0-py37_0
deeptools anaconda/cloud/bioconda/noarch::deeptools-3.5.0-py_0
deeptoolsintervals anaconda/cloud/bioconda/linux-64::deeptoolsintervals-0.1.9-py37h516909a_0
freetype pkgs/main/linux-64::freetype-2.10.4-h5ab3b9f_0
intel-openmp pkgs/main/linux-64::intel-openmp-2021.2.0-h06a4308_610
jpeg pkgs/main/linux-64::jpeg-9b-h024ee3a_2
kiwisolver pkgs/main/linux-64::kiwisolver-1.3.1-py37h2531618_0
krb5 pkgs/main/linux-64::krb5-1.18.2-h173b8e3_0
lcms2 pkgs/main/linux-64::lcms2-2.12-h3be6417_0
ld_impl_linux-64 pkgs/main/linux-64::ld_impl_linux-64-2.33.1-h53a641e_7
libcurl pkgs/main/linux-64::libcurl-7.71.1-h20c2e04_1
libdeflate anaconda/cloud/bioconda/linux-64::libdeflate-1.0-h14c3975_1
libedit pkgs/main/linux-64::libedit-3.1.20210216-h27cfd23_1
libffi pkgs/main/linux-64::libffi-3.3-he6710b0_2
libgcc-ng pkgs/main/linux-64::libgcc-ng-9.1.0-hdf63c60_0
libgfortran-ng pkgs/main/linux-64::libgfortran-ng-7.3.0-hdf63c60_0
libpng pkgs/main/linux-64::libpng-1.6.37-hbc83047_0
libssh2 pkgs/main/linux-64::libssh2-1.9.0-h1ba5d50_1
libstdcxx-ng pkgs/main/linux-64::libstdcxx-ng-9.1.0-hdf63c60_0
libtiff pkgs/main/linux-64::libtiff-4.2.0-h85742a9_0
libwebp-base pkgs/main/linux-64::libwebp-base-1.2.0-h27cfd23_0
lz4-c pkgs/main/linux-64::lz4-c-1.9.3-h2531618_0
matplotlib-base pkgs/main/linux-64::matplotlib-base-3.3.4-py37h62a2d02_0
mkl pkgs/main/linux-64::mkl-2021.2.0-h06a4308_296
mkl-service pkgs/main/linux-64::mkl-service-2.3.0-py37h27cfd23_1
mkl_fft pkgs/main/linux-64::mkl_fft-1.3.0-py37h42c9631_2
mkl_random pkgs/main/linux-64::mkl_random-1.2.1-py37ha9443f7_2
ncurses pkgs/main/linux-64::ncurses-6.2-he6710b0_1
numpy pkgs/main/linux-64::numpy-1.20.2-py37h2d18471_0
numpy-base pkgs/main/linux-64::numpy-base-1.20.2-py37hfae3a4d_0
olefile pkgs/main/linux-64::olefile-0.46-py37_0
openssl pkgs/main/linux-64::openssl-1.1.1k-h27cfd23_0
pillow pkgs/main/linux-64::pillow-8.2.0-py37he98fc37_0
pip pkgs/main/linux-64::pip-21.1.1-py37h06a4308_0
plotly pkgs/main/noarch::plotly-4.14.3-pyhd3eb1b0_0
py2bit anaconda/cloud/bioconda/linux-64::py2bit-0.3.0-py37h14c3975_2
pybigwig anaconda/cloud/bioconda/linux-64::pybigwig-0.3.17-py37hc013797_0
pyparsing pkgs/main/noarch::pyparsing-2.4.7-pyhd3eb1b0_0
pysam anaconda/cloud/bioconda/linux-64::pysam-0.15.3-py37hda2845c_1
python pkgs/main/linux-64::python-3.7.10-hdb3f193_0
python-dateutil pkgs/main/noarch::python-dateutil-2.8.1-pyhd3eb1b0_0
readline pkgs/main/linux-64::readline-8.1-h27cfd23_0
retrying pkgs/main/linux-64::retrying-1.3.3-py37_2
scipy pkgs/main/linux-64::scipy-1.6.2-py37had2a1c9_1
setuptools pkgs/main/linux-64::setuptools-52.0.0-py37h06a4308_0
six pkgs/main/linux-64::six-1.15.0-py37h06a4308_0
sqlite pkgs/main/linux-64::sqlite-3.35.4-hdfb4753_0
tk pkgs/main/linux-64::tk-8.6.10-hbc83047_0
tornado pkgs/main/linux-64::tornado-6.1-py37h27cfd23_0
wheel pkgs/main/noarch::wheel-0.36.2-pyhd3eb1b0_0
xz pkgs/main/linux-64::xz-5.2.5-h7b6447c_0
zlib pkgs/main/linux-64::zlib-1.2.11-h7b6447c_3
zstd pkgs/main/linux-64::zstd-1.4.9-haebb681_0
Proceed ([y]/n)? y
Downloading and Extracting Packages
scipy-1.6.2 | 15.5 MB | ################################################################################################################# | 100%
intel-openmp-2021.2. | 1.3 MB | ################################################################################################################# | 100%
mkl_fft-1.3.0 | 170 KB | ################################################################################################################# | 100%
tornado-6.1 | 589 KB | ################################################################################################################# | 100%
blas-1.0 | 6 KB | ################################################################################################################# | 100%
bzip2-1.0.8 | 78 KB | ################################################################################################################# | 100%
deeptoolsintervals-0 | 72 KB | ################################################################################################################# | 100%
mkl-service-2.3.0 | 55 KB | ################################################################################################################# | 100%
pysam-0.15.3 | 2.5 MB | ################################################################################################################# | 100%
mkl_random-1.2.1 | 287 KB | ################################################################################################################# | 100%
pip-21.1.1 | 1.8 MB | ################################################################################################################# | 100%
pillow-8.2.0 | 622 KB | ################################################################################################################# | 100%
libtiff-4.2.0 | 502 KB | ################################################################################################################# | 100%
curl-7.71.1 | 140 KB | ################################################################################################################# | 100%
libgfortran-ng-7.3.0 | 1006 KB | ################################################################################################################# | 100%
zstd-1.4.9 | 480 KB | ################################################################################################################# | 100%
mkl-2021.2.0 | 144.3 MB | ################################################################################################################# | 100%
krb5-1.18.2 | 1.3 MB | ################################################################################################################# | 100%
numpy-1.20.2 | 23 KB | ################################################################################################################# | 100%
deeptools-3.5.0 | 143 KB | ################################################################################################################# | 100%
jpeg-9b | 214 KB | ################################################################################################################# | 100%
certifi-2021.5.30 | 139 KB | ################################################################################################################# | 100%
setuptools-52.0.0 | 710 KB | ################################################################################################################# | 100%
libcurl-7.71.1 | 305 KB | ################################################################################################################# | 100%
python-dateutil-2.8. | 221 KB | ################################################################################################################# | 100%
olefile-0.46 | 50 KB | ################################################################################################################# | 100%
py2bit-0.3.0 | 22 KB | ################################################################################################################# | 100%
six-1.15.0 | 27 KB | ################################################################################################################# | 100%
python-3.7.10 | 45.2 MB | ################################################################################################################# | 100%
pybigwig-0.3.17 | 77 KB | ################################################################################################################# | 100%
matplotlib-base-3.3. | 5.1 MB | ################################################################################################################# | 100%
libwebp-base-1.2.0 | 437 KB | ################################################################################################################# | 100%
cycler-0.10.0 | 13 KB | ################################################################################################################# | 100%
kiwisolver-1.3.1 | 80 KB | ################################################################################################################# | 100%
plotly-4.14.3 | 3.6 MB | ################################################################################################################# | 100%
pyparsing-2.4.7 | 59 KB | ################################################################################################################# | 100%
freetype-2.10.4 | 596 KB | ################################################################################################################# | 100%
numpy-base-1.20.2 | 4.5 MB | ################################################################################################################# | 100%
libpng-1.6.37 | 278 KB | ################################################################################################################# | 100%
libedit-3.1.20210216 | 167 KB | ################################################################################################################# | 100%
lcms2-2.12 | 312 KB | ################################################################################################################# | 100%
libssh2-1.9.0 | 269 KB | ################################################################################################################# | 100%
retrying-1.3.3 | 16 KB | ################################################################################################################# | 100%
lz4-c-1.9.3 | 186 KB | ################################################################################################################# | 100%
Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done
#
# To activate this environment, use
#
# $ conda activate py38
#
# To deactivate an active environment, use
#
# $ conda deactivate
第五步，激活环境并进入，调取帮助文档查看软件是否安装成功
(base) vip9t07@tpm9-desktop:~$ conda activate py38
(py38) vip9t07@tpm9-desktop:~$ conda list
# packages in environment at /home/data/vip9t07/miniconda3/envs/py38:
#
# Name Version Build Channel
_libgcc_mutex 0.1 main defaults
blas 1.0 mkl defaults
bzip2 1.0.8 h7b6447c_0 defaults
ca-certificates 2021.5.25 h06a4308_1 defaults
certifi 2021.5.30 py37h06a4308_0 defaults
curl 7.71.1 hbc83047_1 defaults
cycler 0.10.0 py37_0 defaults
deeptools 3.5.0 py_0 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
deeptoolsintervals 0.1.9 py37h516909a_0 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
freetype 2.10.4 h5ab3b9f_0 defaults
intel-openmp 2021.2.0 h06a4308_610 defaults
jpeg 9b h024ee3a_2 defaults
kiwisolver 1.3.1 py37h2531618_0 defaults
krb5 1.18.2 h173b8e3_0 defaults
lcms2 2.12 h3be6417_0 defaults
ld_impl_linux-64 2.33.1 h53a641e_7 defaults
libcurl 7.71.1 h20c2e04_1 defaults
libdeflate 1.0 h14c3975_1 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
libedit 3.1.20210216 h27cfd23_1 defaults
libffi 3.3 he6710b0_2 defaults
libgcc-ng 9.1.0 hdf63c60_0 defaults
libgfortran-ng 7.3.0 hdf63c60_0 defaults
libpng 1.6.37 hbc83047_0 defaults
libssh2 1.9.0 h1ba5d50_1 defaults
libstdcxx-ng 9.1.0 hdf63c60_0 defaults
libtiff 4.2.0 h85742a9_0 defaults
libwebp-base 1.2.0 h27cfd23_0 defaults
lz4-c 1.9.3 h2531618_0 defaults
matplotlib-base 3.3.4 py37h62a2d02_0 defaults
mkl 2021.2.0 h06a4308_296 defaults
mkl-service 2.3.0 py37h27cfd23_1 defaults
mkl_fft 1.3.0 py37h42c9631_2 defaults
mkl_random 1.2.1 py37ha9443f7_2 defaults
ncurses 6.2 he6710b0_1 defaults
numpy 1.20.2 py37h2d18471_0 defaults
numpy-base 1.20.2 py37hfae3a4d_0 defaults
olefile 0.46 py37_0 defaults
openssl 1.1.1k h27cfd23_0 defaults
pillow 8.2.0 py37he98fc37_0 defaults
pip 21.1.1 py37h06a4308_0 defaults
plotly 4.14.3 pyhd3eb1b0_0 defaults
py2bit 0.3.0 py37h14c3975_2 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
pybigwig 0.3.17 py37hc013797_0 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
pyparsing 2.4.7 pyhd3eb1b0_0 defaults
pysam 0.15.3 py37hda2845c_1 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
python 3.7.10 hdb3f193_0 defaults
python-dateutil 2.8.1 pyhd3eb1b0_0 defaults
readline 8.1 h27cfd23_0 defaults
retrying 1.3.3 py37_2 defaults
scipy 1.6.2 py37had2a1c9_1 defaults
setuptools 52.0.0 py37h06a4308_0 defaults
six 1.15.0 py37h06a4308_0 defaults
sqlite 3.35.4 hdfb4753_0 defaults
tk 8.6.10 hbc83047_0 defaults
tornado 6.1 py37h27cfd23_0 defaults
wheel 0.36.2 pyhd3eb1b0_0 defaults
xz 5.2.5 h7b6447c_0 defaults
zlib 1.2.11 h7b6447c_3 defaults
zstd 1.4.9 haebb681_0 defaults
(py38) vip9t07@tpm9-desktop:~$ deeptools
usage: deeptools [-h] [--version]
deepTools is a suite of python tools particularly developed for the efficient analysis of
high-throughput sequencing data, such as ChIP-seq, RNA-seq or MNase-seq.
Each tool should be called by its own name as in the following example:
$ bamCoverage -b reads.bam -o coverage.bw
===================分割线====================
大E了，新的报错很快啊，没有闪
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve.
Solving environment: failed with repodata from current_repodata.json, will retry with next repodata source.
Collecting package metadata (repodata.json): done
Solving environment: failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve.
Solving environment: \
Found conflicts! Looking for incompatible packages.
This can take several minutes. Press CTRL-C to abort.
failed
照旧，开始查
参考
python - Installing multiqc on Conda produces "UnsatisfiableError:" - Stack Overflow
Conda incompatibility with CUDA · Issue #1284 · ewels/MultiQC (github.com)
(py38) vip9t07@tpm9-desktop:~$ conda config --prepend channels bioconda --prepend channels conda-forge
(py38) vip9t07@tpm9-desktop:~$ conda config --show channels
channels:
- conda-forge
- bioconda
- defaults
- https://repo.anaconda.com/pkgs/main/linux-64/
- https://repo.anaconda.com/pkgs/free/linux-64/
- https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
- https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
- https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main
- https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free
(py38) vip9t07@tpm9-desktop:~$ conda install multiqc
#中间略
Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done
