2020-03-05 “nf-core”组学分析工具荟萃网站

2020-03-05  本文已影响0人  iColors

生信分析工具五花八门,不同的工具得到分析结果常大相径庭。nf-core为此而生,解决分析流程的标准化、可移植、可重复的问题。汇聚了39个高质量的分析流程,主要的是基因组学,还有部分蛋白质组学分析流程。

网站https://nf-co.re
代码https://github.com/nf-core
文章https://www.nature.com/articles/s41587-020-0439-x

工具列表

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举几个例子,大家慢慢学习。

名称 网站 用途
scrnaseq https://nf-co.re/scrnaseq 单细胞RNAseq
atacseq https://nf-co.re/atacseq ATAC-seq
chipseq https://nf-co.re/chipseq ChIP-seq
mhcquant https://nf-co.re/mhcquant 质谱数据定量
proteomicslfq https://nf-co.re/proteomicslfq 蛋白质组无标定量数据
ddamsproteomics https://nf-co.re/ddamsproteomics 蛋白质组DDA数据
diaproteomics https://nf-co.re/diaproteomics 蛋白质组DIA数据
imcyto https://nf-co.re/imcyto 质谱流式图像分析
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