不好好作图的NCS系列(三)：跟着Cell学多彩火山图绘制①

近日，读到一篇Cell文章如下：

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其中FigureS5的散点图很是吸引我，在主图中也有这种散点图。首先看这个图，图释作者写的是火山图，但是本质还是散点图。这个图中显示的都是差异基因，上调下调都包含，独特之处在于点有不同的颜色，对应legend可以看出是基因功能类型不同，在实际情况中，我们还可以对基因富集进行显示。

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本着简单快速的想法，要实现这个图，我第一个想到的是Graphpad，这个软件很多人都不会陌生，但是用的好可以实现很好的可视化。接下来具体看看。

首先，打开Graphpad，新建一个散点图界面。

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第二步，粘贴差异基因logFC，P值文件，基因的排序最好是按照功能分类。

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第三步，画图，双击Y轴，改变坐标轴，并生成散点图。

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第四步，基本的图已经出来了，只需要对不同的模块添加颜色即可。回到数据页面，选中需要改变颜色的点，点击菜单栏“炸弹”标记，选择symbol color选择中意的颜色。

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多次操作之后，图的雏形就完成了。还是不错的。

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最后一步，添加图例，修饰一下就可以导出图片了。

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效果非常完美，其实Graphpad能够做很好的可视化，不仅仅是局限于统计分析，有空了好好探索下，可能会收获不一样的惊喜！

虽然Graphpad做出了这个图，但是还没有结束，因为这不能满足我的野心，相信很多小伙伴也好奇，R语言版怎么实现呢？其实只要看到这个图的本质是散点图，那就很好办了，应该很快在脑海中形成了思路。下一节我们继续用R语言实现作图！