单细胞代码相关

seurat 对象中的 counts 转成稀疏矩阵barcode

2020-02-17  本文已影响0人  Amor唐
BiocManager::install("DropletUtils")    # 安装 R 包

library(DropletUtils)    # 加载 R 包

# seurat 对象导出 barcodes.tsv.gz、features.tsv 和 matrix.mtx.gz 至 output 文件夹

write10xCounts("output/",seurat_ob[["RNA"]]@counts,version = "3")    
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