自制生信小程序

今天又是学习的一天，学习了用R自制服务器生信小程序，想想以前实习学了两周的perl，真是时光催人老。

其实想要把R脚本变成键入式的小程序也很简单，只需在R脚本下添加参数：

args <- commandArgs(TRUE)

####添加注释内容
if(length(args) !=2){
    cat('usage：Rscript boxplot.R expr group, expr is expr matrix，group is group inf')
    quit("sys error, pls reput")
}else{
expr=read.csv(args[1],header = T,row.names = 1)
group=read.csv(args[2],row.names = 1)
}

然后运行
Rscript R.R arg1 arg2

又画了一张图，对称云雨图

image.png

做ppt有点久，加油

沾了团队的光