生物信息学

2018-08-28 用ascp 从NCBI或者ENA上高速下载

2018-08-28  本文已影响0人  小郑的学习笔记

好久没记录了,突然发现之前学过的一些内容以及忘了,不应该
我之前好大一段时间都在想如何高速下载数据,现在看到最快的就是ascp了。

直接记录一过程吧

  1. 首先从ENA网站下下载数据的下载地址,tab


    比如这样
  1. 然后使用脚本把下载连接提取出来,方便计算机批量下载

这个脚本很简单,正则表达提取,我很早写的,自己也找不到了。。。

  1. 最后运行脚本就可以
    最后差不多就这个样子
这个样子
  1. 记得加上断点续传功能
    ascp -k 1

可以参考
https://blog.csdn.net/jiangpeng59/article/details/72902218

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