Linux-NGS-二代测序分析流程

Bioconductor Workflow 翻译项目限时报名

2019-06-11  本文已影响0人  王诗翔

项目简介

Awesome Bioinformatics Workflow Chinese 是由 Openbiox 翻译小组 发起并维护的优秀 Workflow 翻译项目。

Bioconductor 是生物信息分析过程中绕不过的工具,同时也是我们入们和进阶生物信息极好的学习材料。因此我们将 Bioconductor workflow 的翻译作为 Awesome-Bioinformatics-Workflow-Chinese 的第一期开放项目,并在今后持续更新。

具体内容

根据下载次数,文档质量更新时间和涉及领域等,本次开放 10 个 workflow。分别是:

  1. rnaseqGene:RNA-seq workflow: gene-level exploratory analysis and differential expression (已认领)
  2. simpleSingleCell:A step-by-step workflow for low-level analysis of single-cell RNA-seq data with Bioconductor (已有 1 人,剩余 2 人)
  3. TCGAWorkflow:TCGA Workflow Analyze cancer genomics and epigenomics data using Bioconductor packages (已认领)
  4. systemPipeR: NGS workflow and report generation environment (已认领)
  5. annotation:Genomic Annotation Resources (已有 1 人,剩余 1 人)
  6. methylationArrayAnalysis: A cross-package Bioconductor workflow for analysing methylation array data(限 1-2 人)
  7. rnaseqDTU:RNA-seq workflow for differential transcript usage following Salmon quantification(限 1-2 人)
  8. chipseqDB:A Bioconductor Workflow to Detect Differential Binding in ChIP-seq Data(限 1-2 人)
  9. maEndToEnd:An end to end workflow for differential gene expression using Affymetrix microarrays (已认领)
  10. RnaSeqGeneEdgeRQL:Gene-level RNA-seq differential expression and pathway analysis using Rsubread and the edgeR quasi-likelihood pipeline(限 1-2 人)

招募要求

针对上述尚未(完全)认领的翻译内容 2simpleSingleCell,5annotation,6methylationArrayAnalysis,7rnaseqDTU,8chipseqDB 和 10RnaSeqGeneEdgeRQL 公开招募译者。

具体要求如下:

  1. 乐于学习并愿意分享
  2. 了解 GitHub 并能进行基本操作
  3. 具有相关的实际分析经验优先
  4. 具有一定的翻译经验优先

报名渠道

如果你愿意加入 Awesome Bioinformatics Workflow Chinese 翻译项目,自我提升的同时为开源社区贡献自己的力量,可以发送邮件到 translation@openbiox.org 进行报名。

邮件主题:workflow 翻译报名+姓名

邮件内容需包括如下几点:

  1. 简单精炼的自我介绍
  2. . 报名翻译的项目内容
  3. 目前的学习或工作方向
  4. 是否具有一定翻译经验
  5. 是否了解 GitHub 基本操作

报名截止日期:2019 年 6 月 13 日 24 时

关于 openbiox 翻译计划

openbiox 翻译计划是 openbiox 第一批启动开放项目之一,该项目旨在翻译和维护国外优秀的生物信息相关书籍、技术文档和文章,提升成员自身学习能力的同时提高 openbiox 影响力,帮助国内生物信息学习者和工作者。更详细的信息可以通过官方项目仓库进行了解。

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