一文掌握Rmarkdown分析报表
2019-07-20 本文已影响58人
医科研
作者:白介素2
相关阅读:
R语言生存分析03-Cox比例风险模型
R语言生存分析-02-ggforest
R语言生存分析-01
ggpubr-专为学术绘图而生(二)
ggstatsplot-专为学术绘图而生(一)
生存曲线
R语言GEO数据挖掘01-数据下载及提取表达矩阵
R语言GEO数据挖掘02-解决GEO数据中的多个探针对应一个基因
R语言GEO数据挖掘03-limma分析差异基因
R语言GEO数据挖掘04-功能富集分析
如果没有时间精力学习代码,推荐了解:零代码数据挖掘课程
作者:白介素2
什么是Rmarkdown?
R Markdown是通过R来书写可重复动态报告的一种格式。利用它在幻灯片、pdf、html档、Word文件中嵌入R代码和结果。报告制作流程:
Rmarkdown生成分析报告
Rmarkdown不仅仅是一个简单的markdown拓展运用,它融入了R代码
如何创建Rmd文件
- 点击菜单栏中的:File ▶ New File ▶ R Markdown…
- 窗口弹出。选择.Rmd文件的输出类型
- 单击指定输出类型(亦可随后修改)
-
点击确认,即可创建一个Rmd文件
image.png
如何选择自己的输出格式
image.pngoutput:beamer_presentation# (pdf幻灯片)
output:ioslides_presentation#(htlm幻灯片)
output:word:document#(word文档)
Rmarkdown中的语法
image.png支持markdown语法,但比较严格。
image.png
强调几个比较常见的:
普通文本
italics
italics
- item1
- item2
header1
image_name
这是与简书有区别的地方,图片名放在中括号左侧link
如何嵌入R代码
image.png用```{r} 包围代码块, 以````结束,注意是三个,我为了显示出来,只能这样了,因为markdown会识别.
提交Rmd文件并建立完整分析报告
比较重要的几个代码块参数设置
image.png掌握了以上这些内容基本上这些内容,就能够生存方便高效的数据分析报表,可以方便用作交流传播,当自己需要的时候,也能很快的读懂自己的分析报告.
参考资料链接