RNA-SEQ(七)：TBtools做GO富集分析及R中的可视化
2023-02-23 本文已影响0人
生信小白花
题目：对DEseq2差异分析得到的差异基因进行GO富集。
目的：旨在对基因和蛋白质功能进行限定和描述的。
内容：
1. 下载GO注释背景文件，准备好需要富集的基因列表。
2. 将数据上传到TBtools中进行基因富集。
数据：进一步筛选得到的差异基因列表。
工具：TBtools。
步骤：
- 打开TBtools软件，找到GO enrichment。
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2.在1处可以点下方download在线下载go-basis.obo文件，并上传。2处上传下载好的GO注释背景文件。3处粘贴富集需要的基因列表。然后选择结果文件的储存位置，就可以按下start按钮进行富集。
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结果：
富集得到如下的结果文件。表格中是D2天上调基因富集到的结果，包括分子功能，生物学过程，细胞组分三部分。根据p<0.05进行了筛选，得到的是误差符合要求的通路。
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