TCGA JASON文件对应样本名和文件名
2019-01-14 本文已影响0人
蓝天_乎乎
TCGA JASON文件对应样本名和文件名
参考:https://www.jianshu.com/p/470791a77a1a
http://www.sohu.com/a/220323319_653813
谢谢果子老师代码
![](https://img.haomeiwen.com/i14356707/13ca028485f62d60.png)
以上是2个文件用},{分割
![](https://img.haomeiwen.com/i14356707/2d2ef334f5087a37.png)
1 进入TCGA下载表达量的文件中用cmd tree/F查看树形图
2 和jason对比,找到“file_id”--"file_name" ,以及对应的“entity_submitter_id“(TCGA名)如下图。
![](https://img.haomeiwen.com/i14356707/9435e041f41a545a.png)
知道关系后可以用R读取,进行对应!!!
![](https://img.haomeiwen.com/i14356707/1b0f8e1c0ca2c925.png)