SRA数据合并
2024-04-29 本文已影响0人
花生学生信
把SRR开头的文件夹里的所有.sra数据整合成一个,因为这些文件夹里的都是一个sample生成的SRA数据,
#!/bin/bash
# 检查是否存在output.sra文件,并删除
if [ -f output.sra ]; then
rm output.sra
fi
# 遍历以SRR开头的文件夹
for folder in SRR*/; do
# 将每个文件夹中的.sra文件追加到output.sra中
cat ${folder}/*.sra >> output.sra
done
echo "合并完成"