准备工作----单细胞数据检测SNV与多组学分析
2024-09-16 本文已影响0人
单细胞空间交响乐
作者，Evil Genius
我们的单细胞空间外显子分析课程已经开始了，欢迎大家报名，多组学是分析的潮流，也有助于我们深刻的认识生物学问题，甚至于找到解决问题的方法，单一组学都有局限性，一叶障目并不可取。
中秋节，好好玩。
检测突变最直观的结果就是，直接识别恶性肿瘤细胞。
从单细胞检测数据中获取SNV信息，注意这里强调的是从单细胞 3‘数据中获取突变信息。
完整的分析示例图如下，单细胞表达数据联合突变检测的分析
我们可上讲过了，scRNA的比对是通过star软件进行的，参考基因组一般是hg38，一般会形成bam文件，而我们的单细胞突变信息就是从bam文件中获取的。
甚至我们需要结合SNV和CNV进行分析
各种单细胞识别SNV的方法层出不穷
检测每个细胞的突变情况
