jcvi报错解决

1、报错信息：AttributeError: 'LayoutLine' object has no attribute 'color'

解决方案：在color一列输入指定颜色。

最终layout如下所示：

#y, xstart, xend, rotation, color, label, va, bed

.6, .2, .8, 0, red, sorghum, top, sorghum.bed .4, .2, .8, 0, green, rice, top, rice.bed

# edges e, 0, 1, sorghum.rice.anchors.simple

2、报错信息：AttributeError: 'LayoutLine' object has no attribute 'order'

解决方案：查看最后一行是不是下面还有一行空行，如果有就删除。此外第一行标题一定要正确。

3、报错信息：RuntimeError: Failed to process string with tex because dvipng could not be found

解决方案：缺少dvipng包，下载并按照即可：yum install dvipng