将SRA转为fastq,fastq-dump

2021-09-13  本文已影响0人  一只小脑斧

fastq-dump --gzip --split-files SRR10096826.1.sra

fastq-dump --gzip --split-files SRR10096827.1.sra

重命名:

_S1_L001_I1_001

_S1_L001_R1_001

_S1_L001_R2_001

read type有3种,I1为sample index read, R1为barcode和UMI, R2才是测序read.

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