统计每条序列的长度

1.bioawk

# conda install bioawk
bioawk -c fastx '{ print $name, length($seq) }' < input.fa

输出结果示例：

ctg000090_1436659       1436659
ctg000270_79980027      79980027
ctg000370_2776669       2776669
ctg000380_2896552       2896552
ctg000410_249496        249496

2.seqkit

# conda install seqkit
seqkit fx2tab --length --name --header-line  input.fa

输出结果示例：

#name   length
ctg000090_1436659       1436659
ctg000270_79980027      79980027
ctg000370_2776669       2776669
ctg000380_2896552       2896552
ctg000410_249496        249496