总目录:三阴性乳腺癌全外显子分析(wes)

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10个sra数据已经转换成了fa格式

(base) pc@pc-System-Product-Name:/data/fudan_TNBC$ ls *|head
SRR7696207.sra
SRR8517853.sra
SRR8517854.sra
SRR8517855.sra
SRR8517856.sra
SRR8517857.sra
SRR8517858.sra
SRR8517859.sra
SRR8517860.sra
SRR8517861.sra

其中，10个sra文件已经转成了fq

(base) pc@pc-System-Product-Name:/project/raw_fq$ ls -al
total 99940864
drwxr-xr-x 2 root root       4096 4月  26 11:22 .
drwxr-xr-x 4 root root       4096 4月  26 11:22 ..
-rw-r--r-- 1 root root 2409631164 4月  26 10:28 SRR7696207_1.fastq.gz
-rw-r--r-- 1 root root 2622904583 4月  26 10:28 SRR7696207_2.fastq.gz
-rw-r--r-- 1 root root 5459351385 4月  26 11:08 SRR8517853_1.fastq.gz
-rw-r--r-- 1 root root 6174263716 4月  26 11:08 SRR8517853_2.fastq.gz
-rw-r--r-- 1 root root 4258578043 4月  26 10:53 SRR8517854_1.fastq.gz
-rw-r--r-- 1 root root 4789136061 4月  26 10:53 SRR8517854_2.fastq.gz
-rw-r--r-- 1 root root 4643630167 4月  26 10:56 SRR8517855_1.fastq.gz
-rw-r--r-- 1 root root 5077161767 4月  26 10:56 SRR8517855_2.fastq.gz
-rw-r--r-- 1 root root 4438156606 4月  26 10:53 SRR8517856_1.fastq.gz
-rw-r--r-- 1 root root 4822235700 4月  26 10:53 SRR8517856_2.fastq.gz
-rw-r--r-- 1 root root 6258570984 4月  26 11:15 SRR8517857_1.fastq.gz
-rw-r--r-- 1 root root 6971760413 4月  26 11:15 SRR8517857_2.fastq.gz
-rw-r--r-- 1 root root 4187608398 4月  26 10:50 SRR8517858_1.fastq.gz
-rw-r--r-- 1 root root 4540971154 4月  26 10:50 SRR8517858_2.fastq.gz
-rw-r--r-- 1 root root 6405987600 4月  26 11:16 SRR8517859_1.fastq.gz
-rw-r--r-- 1 root root 7151209734 4月  26 11:16 SRR8517859_2.fastq.gz
-rw-r--r-- 1 root root 5066858826 4月  26 11:03 SRR8517860_1.fastq.gz
-rw-r--r-- 1 root root 5689480295 4月  26 11:03 SRR8517860_2.fastq.gz
-rw-r--r-- 1 root root 5388198396 4月  26 11:05 SRR8517861_1.fastq.gz
-rw-r--r-- 1 root root 5983621495 4月  26 11:05 SRR8517861_2.fastq.gz

1 转换剩余的sra文件为fa格式