化生_01

2020-03-15  本文已影响0人  RachaelRiggs
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基因组学的局限性:
1.生命体系是活动的,基因组学通过敲低敲除某些基因实际上是机体adoption的结果,且某些生长必须基因是不可敲除的
2.KOKD无法定量,因为有些pathway是有threshold的,而KOKD无法控制量

small chemical probes
GFP 无法加到lipid和糖类上,只能通过化学小分子 生物正交反应,标记定位
drawbacks of small chemical probes:
offtarget-结构专一性差,无差别结合到大蛋白上可能性大

化学生物学界的教授

1.Stuart L Schreiber


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FK506是大环内酯分子结构如上,可以钓出来binding protein,FKBP12就是这样钓出来的;
Schreiber认为,化学小分子可以调控信号传导。化学小分子和pro-FKBP12的ligation可以改变complex蛋白构象,使得它们能够target其他的protein。S找到这样一个phosphatase叫calcineurin,在免疫抑制方面发挥重要作用;
Stuart L Schreiber同时也是protein mTOR发现者的老师

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sequence a nontrivial task in those days

mTORC1和mTORC2有kinase domain调控下游多条通路。


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mTOR在肿瘤治疗和代谢中的作用,通过rapamycin抑制mTOR的作用,延缓衰老。

稳定同位素没有放射性,如何区分它和正常的同位素呢?


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环状葡萄糖
研究glucose的代谢过程,可以看葡萄糖的代谢流分析


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例如:病毒侵入细胞后,代谢途径的改变


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例如:在DENV下glucose的uptake增加
该领域Rabinowitz--研究抗病毒的脂质代谢流分析


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2.Peter G.Schultz
把非天然氨基酸放到protein中,可以用化学的方法追踪。


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疫苗思路:产生利用非天然氨基酸的病毒,可以打到机体以后,产生抗体,同时这种病毒进入体内以后不能利用机体内的氨基酸自我合成。


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Principles
1.需要的探针是有specificity的
2.分子之间的识别
3.分子在水相中反应,且不受氧气的影响
三个主要的反应:

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