以脆性X综合征研究为例看自闭症的基因编辑治疗
椰菜君前前后后介绍了二三十个和自闭症密切相关的基因,比如导致脆性X综合征的FMR1,导致瑞特综合征的MECP2,导致结节性硬化综合征的TSC1/2,还有SHANK3、SCN2A、ANK2等尚未取得独立名分的基因。从这方面看,自闭症研究形式一片大好,不是小好,在向自闭症的生理根源逐渐靠近,慢慢远离诊断靠猜,治疗靠蒙的窘迫境地。
令椰菜君深感不安的是,时不时有家长走了眼,认砖家作专家,请椰菜君鸭子上架,看一下他们孩子的基因分析结果,询问可有什么救治办法。。。
呜呼,除了说一句基因编辑技术正在迅猛发展,在不远的将来必定能从基因层面解决自闭症治疗外,椰菜君还能说什么呢?
其实科学家们已经很努力了。。。但科研这事,既需要砸钱,又需要机遇,还需要时间。。。
近日蒙几位脆性X综合征患儿家长错爱,要椰菜君谈谈该病的治疗研究,因而借此机会聊聊基因编辑技术及其在脆性X综合征治疗上的进展,关注这个话题的其它家长读者也可借此了解一些情况。
先简单介绍一下基因编辑技术。
基因编辑,和文章编辑也没什么不同,看基因——文章哪个地方有问题不顺眼,拿起“剪子”咔嚓一声剪掉,再贴上自己合心的一段基因——文字,也就是了。
这个编辑过程,有三步要做。首先,得找到要编辑的位置;其次,剪掉不需要的部分;最后,填进去正确的内容。
对于基因编辑,这三步的困难就大了,而其中第一步简直不可逾越。
人的基因都记载在DNA碱基对上,编辑基因就是修改DNA碱基对。但人的DNA真是长长长长长长长长长长长长长长长长长长。。。
每个细胞里面都有一套DNA,从头到尾算下来有30亿个碱基对;而人体有30,000,000,000,000个细胞,所以。。。
从这么长的DNA上找到要编辑的位置,可以设想你要从四库全书,或者是永乐大典里面找到一个错别字。
椰菜君读书的时候,想要用基因编辑方法修改一支老鼠的某一个基因,即使在日落西山气息奄奄的美帝,起码也要消耗整整一个博士研究生四五六七年的时间,做成洋洋洒洒一大篇博士论文。更多的时候,是辛辛苦苦做实验养细胞给耗子把屎把尿几年,拿到的耗子根本不是想要的!学生固然崩溃嚎哭,教授更是长吁短叹,担心明年的饭碗在哪里,妥妥的大型人间惨剧。
究其原因,主要是工具不顺手,找不准要编辑的位置。当年的工具,虽然从原始的核酸酶进化到锌指酶进化到TALEN酶,万变不离其宗,都是靠酶来识别要编辑的位点。但是这酶的能力有限啊,使用者需要自行根据要编辑的位点来修改这个酶。。。
设想你要编辑一个WORD文档,你花大价钱买了一个编辑器软件,你打开一看说明,才知道这其实是一个C语言开发包。。。
当然我们知道,拿着C语言,没有什么是完成不了的。但那是大神的事情,小猫小狗,只有被虐的份。
估计是看多了博士生的悲剧,十年前天空一声雷响,CRISPR闪亮登场,颠覆了基因编辑领域。
怎么说呢,CRISPR虽然还没有到微软OFFICE的地步,至少也到了NOTE的地步!您呐,就是对编程一窍不通,只要眼睛不瞎手指还能动,用个记事本写点什么有问题吗?
原因很简单啊。CRISPR的核心是Cas9酶和引导RNA。只要根据想编辑的DNA来设计合成出一小段引导RNA——又快又容易又便宜还不会出错,把它交Cas9酶,两位就齐心协力工作去了!Cas9酶会扭开DNA,一边顺着DNA链往前爬,一边用这个引导RNA来对比DNA;一旦找到配合的位置,咣!这个Cas9酶就会手起刀落,把DNA从这里一刀挥为两截。。。
您想想看,记事本虽然这么原始落后,但它有查找替换功能啊!您只要把想查找的词放进去,它就自动给您找出来,给您替换好!比您戴眼镜一页一页翻书,左手剪刀右手浆糊,不强一百万倍吗?
有了这么牛逼的CRISPR技术,基因编辑治疗疾病不应该是指日可待吗?
问题是,工具是有了,也比较好使了,但离实际应用,还有很长的路要走。
比如,怎么把这工具给送到人体细胞里面去呢?Cas9是一个酶,酶不能自行穿过细胞膜进入细胞核;引导RNA呢,极其脆弱——做过RNA研究的人都知道,RNA简直太脆弱了!一个唾沫星子飘到试管里面,RNA就团灭了!因此,如何把Cas9酶和引导RNA给安全送到细胞里面,送到每一个脑细胞里面,送到身体的每一个细胞里面,是最大的拦路虎。
比如,即使成功地把工具送到细胞里面,后来发生的事情也难以预料。因为这个Cas9酶,得顺着DNA链一边爬,一边对比。那么能不能爬上去,爬上去的位置离目的地多远,能不能爬到等等,差不多都要看天吃饭。
比如。。。万一编辑错了位置呢?把🐔🐔给编辑软了?
这些问题,都得妥善解决,方才能走到用来治病那一天。对于自闭症包括脆性X在内,又是困难中的困难,因为大脑是身体防护最严密、最娇嫩的器官,稍有不慎,基因没有编辑成功,脑子倒给搞坏了。
对于脆性X综合征,基因编辑的目标非常清晰,就是把FMR1基因前端的那一长段CGG片段给切掉一大块,比如从致病的两百多重复片段(全突变)给切到正常的几十个片段,让FMR1基因能够正常表达,也就是了。
第一项尝试研究发表于2015年,研究对象是含有全突变FMR1基因的人诱导干细胞。之所以采用干细胞,显然是做事从最简单地开始,要是单个细胞的基因都编辑不成功,那也甭想去试脑子了。
用细胞做实验,就简单多了。要做的事情就是把细胞放在一个小试管里面,再添上一些特殊的质粒——就是一种环状DNA,含有Cas9酶和引导RNA的基因序列,然后⚡⚡⚡!
可不是电击痉挛疗法,但也是如假包换的电击了!在电击之下,细胞的细胞膜会瞬时被击穿出一些小孔,质粒趁机拱进去。。。这个质粒比较特殊,能够欺骗细胞,把它当成自己的一部分,并用它开始制造Cas9酶和引导RNA了!这就叫曲线救国!
有了Cas9酶和引导RNA,后面的事就交给它们处理了!但是如所预料,两位的办事效率并不高,只有约2~3%的细胞完成了基因编辑,但可庆幸的是,凡是完成了编辑的细胞,全突变的FMR1基因都给改正好了!都开始正常工作了!更重要的是,在把这些改好的干细胞给诱导成神经细胞后,它们继续正常工作!
因此,用牛逼的CRISPR技术来编辑突变的FMR1基因是可行的了!
也有人采用了另外的办法。既然Cas9酶会剪断DNA,那终究是有些危险的,万一它失去控制,乱砍乱剪,如何是好?不若把它给阉割了,叫它只能去寻找编辑位置,但不能剪切DNA,就保证不会乱来。但出错的FMR1基因怎么办呢?不要紧,虽然出错的原因是这个基因前面的CGG片段太长,但太长不是罪,太长了还被完全甲基化才是罪!所以聪明人在阉割了的Cas9酶后面嫁接了一个脱甲基化酶。。。
喵!这次不用电击了,而是用能自己拱进细胞的病毒了!病毒拱进细胞后,如法制造Cas9酶和引导RNA。等Cas9酶找到编辑位点,拖上的脱甲基化酶就把CGG给去甲基化,这FMR1基因就正常工作了!犹如编辑文章的时候不是剪掉,而是把要删除的部分打个删除线! 这样处理后的细胞,FMR1基因的活动能力增加了480倍,并在移植到小鼠大脑中后,还正常工作至少三个月!
但是呢,这里拿去治病还差着老远,因为你可不敢电击大脑——事实也没法把大脑分成一个一个的细胞,也不敢把病毒给注射到大脑里面,还不谈两种方法效率都偏低了。
一个聪明的办法是,事先造好Cas9酶和引导RNA,然后把它们给伪装起来,简单说是用一种特殊的纳米颗粒给包裹起来,混过细胞膜,再释放出来工作。这样的策略在2018年的时候,成功地在小鼠上得到了验证。不过呢,这次不是直接编辑FMR1基因,而是编辑一个受FMR1基因控制的基因,叫做mGluR5。
这样做的原因,是因为若FMR1基因不工作,mGluR5基因就会失去控制,导致各种后果。那么直接把一部分mGluR5基因给搞死,岂不是围魏救赵?当然椰菜君觉得,这些研究者应该是从简单出发,只用基本的编辑工具——单单剪断mGluR5基因而不需要考虑修补,适合用纳米颗粒来伪装罢了。
总之,这个围魏救赵的策略显示了效果,小鼠的一些异常行为比如刻板等,确实得到了改善。不过更重要的是,这个研究找到一个简单可行办法,只要把工具给注射到大脑里面,虽然是小鼠的大脑,就可以实现给部分脑细胞做基因编辑的目的,距实用又进了一大步。
虽然如此,何时能在脆性X综合征患者身上进行基因编辑治疗还是未为可知。以这个纳米颗粒输送为例,和人比起来,小鼠的大脑真是小太多了,只需要注射不多的纳米颗粒,就可以扩散开来,但人的大脑呢?要注射多少才行呢?这些纳米颗粒会不会有什么潜在的危害?毕竟这是大脑啊,开不得玩笑。
对于其它导致自闭症的基因,实施编辑肯定会遇到同样的困难,甚至更多的困难。不过,显而易见的事实是,在用基因编辑技术治疗脆性X综合征,治疗自闭症的道路上,研究者正在快马加鞭前进!一万年太久,只争朝夕!
参考文献:
CRISPR to the Rescue: Advances in Gene Editing for the FMR1 Gene. Brain Sci. 2019 Jan; 9(1): 17.