Cytoscape学习小结

 先准备数据（有差异表达基因和上下调关系）

将差异表达基因粘贴到STRING网站，一直点continue（如果前面还在转圈就不能点continue）

点击seting，并将独立的节点隐藏

可以看出有397个节点，并下载tsv文件（可以直接导入cytoscape的文件）

导入刚刚下载的tsv文件

点cytoscape中的style选项，选择自己喜欢的风格（没有放图）

需注意下图的选项会将所有之前做的改变都清零（更改过后，需谨慎点击）

然后将DEGs的表达情况（之前准备的包含上下调的csv文件）上传到cytoscape

上传的时候我将X1_1重新命名为expression，然后继续设置风格：

继续滑向下

导出

其实导出为PDF更方便以后修改