单（核）细胞、VDJ、ATAC个性化分析大合集

作者，Evil Genius~~~

被隔离了，受单细胞测序网的邀请做了一次直播课，PPT放给大家，希望大家都能有所收获，每次都有人问我关于单细胞空间的分析问题，之前呢，大多数教程都是关于空间转录组的，其实我是最早做单细胞分析的一批人，后来去了空间，不过目前而言，单细胞远比空间火的多。所以这里把单细胞所有的个性化分析来了一个大汇总，内容非常多，讲了将近4个小时。

好了，开始分享PPT，当然了，很多文章我设置了收费，不过一般都几块钱，收费不是目的，目的是分享给大家一些内容，大家能请我喝瓶饮料而已，老毛病了。当然也感谢诺禾的知遇之恩，人生的关键选择就那么几步，诺禾是第一步。

三个方向

图片.png

18年的年度技术

图片.png

技术的演变

图片.png

个性化分析的多样性

图片.png

双细胞的去除

图片.png

R版本的软件DoubleFinder

图片.png

python版本的引用率较高

图片.png

双细胞去除的软件比较

图片.png

单细胞数据的降噪分析

图片.png

降噪分析的软件比较

图片.png

SAVERX效果最好

图片.png

降噪分析有助于提高标准分析的精度

图片.png

排污分析

图片.png

SoupX效果最好

图片.png

排污分析的原理

图片.png

细胞注释

图片.png

细胞注释的参考链接在单细胞个性化分析之细胞注释篇

轨迹分析

图片.png

轨迹分析的分化类型