RIP-Seq（1）--实验原理及技术路线
2022-05-30 本文已影响0人
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1.实验原理
RIP-seq（RNA immunoprecipitation and deep sequencing）是RNA免疫沉淀与高通量测序结合的技术，它通过免疫沉淀目标蛋白来捕获蛋白体内结合的RNA。将捕获的RNA进行高通量测序，可获得RNA结合蛋白（RBP）在体内与众多RNA靶标的结合模式，并对其结合强度进行精确定量，最终通过分析目的蛋白在体内结合RNA的动态变化，阐述出目的蛋白对基因表达调控的分子机制。
2.技术路线
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RIP-Seq数据分析的原理与过程和ChIP-seq十分相似，所以这里略过前面的质控，简单说明比对和peak calling步骤
