技术方法—云计算_Nature Methods
2020-08-12 本文已影响0人
安哥生个信
历史推荐汇总：
2019年共推荐81篇单细胞领域高分文章（单细胞文献速递81篇·再见2019)。
2020年1-3月供推荐56篇单细胞领域高分文章（2020年一季度·单细胞文献速递56篇）
序号：2020-121
编者按：
在单细胞测序不断为我们输出大量数据的同时，开发相应算法和程序来辅助我们更简易高效地分析大规模数据也是非常必要的。
Cumulus 为大规模单细胞以及单核RNA测序提供云数据分析
【文献类别】技术方法—云计算
【发表期刊】Nature Methods
【影响因子】 30.8
【发表时间】2020-07-27
【PMID】32719530
【文章摘要】大规模平行的单细胞和单核RNA测序为健康和疾病中的系统组织图谱开辟了道路，但是随着数据生成规模的不断增长，对用于规模化分析的计算途径是迫切需要的。在此，研究人员开发了Cumulus——一款用于进行大规模单细胞和单核RNA测序数据集分析的云框架。Cumulus 通过将云计算的功能与算法和执行方面的改进相结合，实现了高扩展性，低成本，用户友好性以及对一系列功能的集成支持。研究人员在骨髓细胞的免疫细胞数据集的人类细胞图谱中对Cumulus进行了基准测试，结果表明Cumulus比常规计算框架的效率有显著提升，同时维持或改善了结果的质量，从而可以进行大规模研究。
如果对分享的文章感兴趣，可扫描下方二维码
申请加入欧易-单细胞测序交流QQ群（群号：551203013）
单细胞文献速递的相关文章均可进群下载
根据序号下载相应文章
