生信分析 超全R配色盘汇总

嘿~

有没有一种困扰：用R画图的时候，总觉得配色丑丑的，想换，搜一下，一篇文里就推荐了一两个配色盘，不够呀。。。怎么办？我来咯~私藏干货全公开！以下开启直男癌式分享。。

RColorBrewer包

命令display.brewer.all()查看所有配色：

使用也很简单，指定取色数目和调色盘名称即可：

brewer.pal(n, name)

2. colorRampPalette()

非常适合于热图配色，比如生成红色到绿色的渐变色：

col_fun <- colorRampPalette(c('red', 'blue'))

col_fun(10)

colorRampPalette实际返回的是一个function，我们调用这个function，并指定取色数目就好啦。colorRamp和colorRampPalette功能一样，就是用colorRamp得到的是RGB，而colorRampPalette得到的是十六进制颜色码。

3. ggplot绘图时直接+scale_fill_*或+scale_color_*

可以在打出scale_fill_或scale_color_后按TAB查看所有函数，比如scale_fill_brewer可以用以上RColorBrewer中的配色；scale_color_viridis_d的紫黄配色也很经典耐看：

4. gplots包的colorpanel()

也是用于生成渐变色的配色盘，比如生成红色到绿色渐变：

colorpanel(10, low = 'red', mid = 'white', high = 'blue')

5. ggsci包

专门为期刊审美而生的调色盘，就连配色名称都和期刊一样，着实被酷到了。所有配色及使用参考官方：https://nanx.me/ggsci/articles/ggsci.html，我就贴几张示例：

6. 还有一些其他的，但我不太爱用的：rainbow``()、heat.colors``()、terrain.colors``()、topo.colors``()、cm.colors``()、viridis``()。。。。

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