GEO分析

GEO分析

今天开始学习GEO分析！从看到的GEO博文中选择一些系列分享出来。

GEO数据库基础知识

Gene Expression Omnibus database (GEO)是由NCBI负责维护的一个数据库，设计初衷是为了收集整理各种表达芯片数据，但是后来也加入了甲基化芯片，甚至高通量测序数据！

解读GEO数据存放规律及下载，一文就够

解读SRA数据库规律一文就够

从GEO数据库下载得到表达矩阵 一文就够

GSEA分析一文就够（单机版+R语言版）

根据分组信息做差异分析- 这个一文不够的

差异分析得到的结果注释一文就够

用GEOquery从GEO数据库下载数据

ID转换大全

R来完成表达芯片分析全流程

多个探针对应同一个基因取最大表达量探针极简代码

一万人陪你学习GEO数据库挖掘知识（视频听课笔记分享）

资源！果子的GEO芯片分析教程汇