如何优雅的把CSMAR(国泰安)数据导入R和Python
前言
CSMAR(国泰安)数据库是经济金融相关的科研工作者用到的最多的数据库之一。它提供了丰富全面的上市公司财务及金融数据,以及一些行业宏观层面的数据。但是,它并没有像WRDS(沃顿研究数据服务)等数据库提供丰富接口(如SAS,R等)供下载,只能在网页上下载好数据然后导入到相应的分析软件进行分析。
我在最近使用该数据库时发现,虽然CSMAR(国泰安)数据库可以提供CSV格式下载,但限制每次只能有300,000条查询,而且在导入R的过程中总是报错。另外还有其他的可以导入R的txt格式,但无一例外都出现错误,无法导入成功。最终无奈选择xls格式,而xls格式由于自身的限制,每个文件只有65,000条数据。
因此把CSMAR数据导入R就变成了两个问题:
- 批量导入excel数据文件。
- 为每个变量添加标签。(因为许多变量名并不能直观的知道它的意思,而Rstudio里面显示每个变量标签就方便多了)
完成之后,在Rstudio里面的样式是:
一步一步来
安装两个packages:
install.packages(c("tidyverse", "readxl"))
下载数据并解压在一个文件夹里,我们以CSMAR里面基金表现数据为例:
如图,每个子文件夹里面又有很多xls文件,和标签说明的txt文件。
读取xls文件的list:
library(tidyverse)
library(readxl)
filepath <- "~/基金表现/"
list <- list.files(filepath,
full.names = TRUE, # 读取完整路径
recursive = T, # 读取所有的子文件夹
pattern = "\\.xls" # 只读取 .xls文件,也可以改成 .xlsx
)
## 读取该文件夹下面所有子文件夹的xls文件
每个excel的文件如下:
这个excel里面第一行是变量名,第二行是标签,第三行是单位,数据从第四行开始,那么读取所有excel表的数据:
先读取数据
# 数据部分
data <- list %>% as_tibble() %>%
mutate(DF = map(value,
~ read_excel(., skip = 3,
col_names = F))) %>%
select(-value) %>%
unnest()
# 从一个文件中提取变量名称
names <- read_excel(list[1],col_names = T) %>% names()
# 从文件夹的txt文件里面提取变量名
labels <- read_excel(list[1],skip = 1) %>% names()
最后把变量名和labels加入data中:
# 先写一个加label的函数
addlabel <- function(dat, vlist, labellist) {
for (v in vlist) {
attr(dat[[v]], 'label') <- labellist[which(vlist == v)]
}
dat
}
# 给数据加变量名字
names(data) <- names
# 给变量加labels
data <- addlabel(data, names(data), labels)
其实你只需要下面这个函数!
当然你看完这篇文章就不需要这么麻烦了,直接复制下面的函数就可以了!
# 读取文件夹里的,包括子文件夹的所有xls
CSMARxlsDF <- function(filepath){
library(tidyverse)
library(readxl)
list <- list.files(filepath,full.names = TRUE, recursive = T,
pattern = "\\.xls")
names <- read_excel(list[1],col_names = T) %>% names()
# generate labels
labels <- read_excel(list[1],skip = 1) %>% names()
data <- list %>% as_tibble() %>%
mutate(DF = map(value,
~ read_excel(., skip = 3,
col_names = F))) %>%
select(-value) %>%
unnest()
# 先写一个加label的函数
addlabel <- function(dat, vlist, labellist) {
for (v in vlist) {
attr(dat[[v]], 'label') <- labellist[which(vlist == v)]
}
dat
}
# 给数据加变量名字
names(data) <- names
# 给变量加labels
data <- addlabel(data, names(data), labels)
return(data)
}
如果只有一个excel文件,那就更简单了
# 读取文件夹里的,包括子文件夹的所有xls
CSMARxlsDFone <- function(onefilepath){
library(tidyverse)
library(readxl)
names <- read_excel(onefilepath,col_names = T) %>% names()
labels <- read_excel(onefilepath,skip = 1) %>% names()
data <- read_excel(onefilepath, skip = 3, col_names = F)
# 先写一个加label的函数
addlabel <- function(dat, vlist, labellist) {
for (v in vlist) {
attr(dat[[v]], 'label') <- labellist[which(vlist == v)]
}
dat
}
# 给数据加变量名字
names(data) <- names
# 给变量加labels
data <- addlabel(data, names(data), labels)
return(data)
}
以后只要把下载的数据放在一个文件夹里,并提供该文件夹的路径,就可以得到一个well-organized dataset!
导入python
其实,如果用Rstudio的话可以直接在里面运行python代码会更快速:
在R里面readxl
package里面的read_excel( )
只能选择skip 几行,比如skip = 3
表示忽略前三行。但是,在python里面的pandas
提供的read_excel()
里面的skiprows可以给出一个list作为参数比如skiprows = [1,2]
表示忽略第二行和第三行,(python里面0表示第一个) 但仍然保留第一样的变量名称,对我们这个例子非常有用!
在Rstudio里面添加python chunk就可以直接运行了
python和R之间进行数据沟通的时候,一个好用的格式是
feather
, python里面安装可以通过pip install feather-format
完成。
path = "~/基金表现/"
import pandas as pd
import os
import feather
filesxls = [os.path.join(root, name)
for root, dirs, files in os.walk(path)
for name in files
if name.endswith((".xls"))]
data = [pd.read_excel(f,skiprows = [1,2]) for f in filesxls]
all_data = pd.concat(data)
labels = pd.read_excel(filesxls[0], skiprows = [0]).columns.values.tolist()
labels = pd.DataFrame(labels)
feather.write_dataframe(labels, '/Users/Sean/labels.feather')
feather.write_dataframe(all_data, '/Users/Sean/data.feather')