【R】一条命令搞定相关性图

2022-11-18  本文已影响0人  生信交流平台

前面小编给大家讲解过

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今天小编给大家安利一个R包,PerformanceAnalytics,只需要一条命令就可以绘制出很酷炫的相关性图。

#安装PerformanceAnalytics
install.packages("PerformanceAnalytics")

#加载PerformanceAnalytics包
library(PerformanceAnalytics)
#加载数据
data(managers)

我们使用的数据如下


#一条命令绘制相关性图
chart.Correlation(managers[,1:8], histogram=TRUE)

可以得到下面这张酷炫得相关性图


图片说明:

1、对角线为样本自身表达量分布图,histogram;

2、下三角形(对角线的左下方),给出了特征两两之间在所有样本里面表达值的散点图,红色曲线为拟合曲线;

3、上三角形(对角线的右上方),数字表示两个特征的相关性值,表示显著程度( p < 0.05, ** p < 0.01, *** p < 0.001)。

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