GWASGWAS分析-说人话

GWAS分析-说人话(16)- "一键提取“所有染色体需要的表型

2020-08-14  本文已影响0人  医学小蛋散

前言

这个其实是“GWAS分析-说人话(7)keep提取我们需要的表型数据 III”的续编IV

没错,只要你的需求(daoshi)不是什么变态,

一般都是要所有染色体都提取数据的。


留意哦,简短粗暴:

Terminal中发动for循环!~

for ch in `seq 22`; do /Users/xxx/plink --noweb --file /Volumes/xxx/chr$ch --keep /xxx/你想要提取的文件.txt --recode --make-bed --out 你想要的文件名$ch; done

是的,以上~

进一步了解--keep功能,请到:

1.GWAS分析-说人话(5)keep提取我们需要的表型数据 I

2.GWAS分析-说人话(6)keep提取我们需要的表型数据 II

3.GWAS分析-说人话(7)keep提取我们需要的表型数据 III

上一篇下一篇

猜你喜欢

热点阅读