确定蛋白浓度（二）|自学生信Python（第二十二天）

确定蛋白浓度（二）

问题回顾：如何将原始数据表(表 7. 1)转换为更简单的表(表 7.2)?

在下面的 Python 会话中，会对初始表，即包含数个列表的列表执行一些操作步骤，将一个新函数zip() 使用两次:第一次，将表调转了 90° ，第二次，组合表中的两列以获得一个新的二维表。
其参考代码如下：

table = [
    ['protein','ext1','ext2','ext3'],
    [0.16,0.038,0.044,0.040],
    [0.33,0.089,0.095,0.091],
    [0.66,0.184,0.191,0.191],
    [1.00,0.280,0.292,0.283],
    [1.32,0.365,0.367,0.365],
    [1.66,0.441,0.443,0.444]

]
table = table[1:]
protein,ext1,ext2,ext3 = zip(*table)
extinction = ext1+ext2+ext3
protein = protein*3
table =zip(protein,extinction)
for prot,ext in table:
    print(prot,ext)

输出结果为：

命令的含义

启动该程序，会打印转化为双列格式的表格。 程序分为两部分。 在顶部，数据写成嵌套其他列表的列表格式。 使用这种嵌套列表，该程序就能清晰地表示二维数据。 在底部，该转换由 5 个步骤完成。
①首先，删除标签行（table = table[1：]）;
②其次，创建四个元组， 每个包含一列数据(protein， ext1, ext2, ext3 = zip( table));
③第三，将消光值列复制到一个元 组(extinction = ext1 + ext2 +ext3)，并将蛋白质列相应地延长 (protein = protein3) 。 这里，蛋白质元组乘以 3. 使相同的值重复三次，因为在上表中一个蛋白质对应三个消光值;
④第四，两列组合成一个新的二维表(table = zip(protein, extinction) );
⑤最后，将表的内容 逐行打印，
其结果是含有蛋白质的浓度和相应的消光值对的嵌套列表。

二维表的表示方法

我们先从含有一列蛋白质浓度和三列消光值的表开始(见表 7.1)。table 变量的类型是包含其他列表的列表。 任何表可以被编码为含有列表的列表，也称为嵌套列表。 例如，表

可以编码为嵌套列表
square = [[1,2,3] , [4,5,6] , [7,8,9]]

或嵌套元组的列表

square = [(1,2,3) , (4,5,6) , ( 7,8,9 )]

Python列表可以保存所有类型的数据，也包括其他列表。 在由嵌套列表表示的表中，有一个单一的外列表(包含内部的行〉和内列表(一行一个) .外列表包含内列表，这样表就有了清晰的结构。 此嵌套列表结构又称为二维阵列。

问答: 能否使用 python三维表?
能有多少列表相互嵌套并没有限制 。 例如，可以创建一个 2x2x2 元素的三维列表如下:
cube = [[[0,1],[2, 3]],[[4,5], [6,7]]]

三维表创建后，数据规模可能很快就会变得非常巨大(例如，如果表在每个维度有 100 个位 置，那么将是 100^3或 10^6个单元格的表)。有了这样的数量级 ， 程序很容易变得非常慢，除非能使用复杂的算法并有大量的内存和/或功能强大的计算机。有一条经验法则是， 当数据越多时，就越必须提前计划。 当数据变得更复杂时，用像[1][2][3]这样的索引访 问列表就会十分复杂低效，这时类可以使数据更具有可读性。

访问行和单元格

将表格表示为嵌套列表后，可以通过索引访问各行，以同样的方式也可以访问任何列表。 例如，访问第二行可以用如下指令(索引从 0 开始) :

second_row = table[1]

通过添加表示列数的第二个索引，可以访问单元格。例如，第二行的第三列中的单元可以这样访问:
second_row_third_column = table [1][2]

或者，如果要操作数据， 则可以把它赋给指定单元格:

table [1][2] = 0.123

用单个 for 循环，可以对表中的所有行进行操作 :
for row in table:
print(row)

用 for 双循环，可以依次访问各行的每个单元格 :

for row in table:
for cell in row:
print(cell)
在 Python 的嵌套列表中，访问行和单元格是最简单的操作。后面将讨论稍复杂的访问列操作。

日常结尾：
虽然这是个小小的计算程序，但对于初学者的我来说每一次对原代码的升级改造，哪怕是读懂后的注释都感觉是一次进步提升，总之代码虽小，动手最重要！希望更多学习Python的爱好者不要像我一样眼高手低，学习编程就是要，思考，敲码，思考，敲码，敲码，再敲码！!