手把手教你做单细胞测序数据分析（七）—— 基因集富集分析
2022-07-20 本文已影响0人
Biomamba生信基地
往期回顾B站中只有视频课程，代码部分整理在往期推送之中：
手把手教你做单细胞测序数据分析（六）——组间差异分析及可视化
其他单细胞相关技术贴也在这里：
如果这期视频看不懂，你可能需要看看这些：
上一讲中我们已经教会了大家如何对多样本的数据做差异分析，拿到差异基因列表。通常情况下差异基因数量是非常多的，显然拿着这么长的list直接撰文是不科学的。这时就需要我们利用一定的“先验”通路，去评估我们获得的差异基因集，从而帮助大家更好的了解自己手中的数据，解释好数据背后的生物学意义，向文章迈进!
在线做富集分析DAVID：
https://david.ncifcrf.gov/当然，我不是很推荐这种，原因在这里：
PPI同样有这个功能，视频里我们也演示了：
如果你想使用clusterProfiler又不想写代码：
老俊俊的生信笔记（公众号）
http://139.186.136.72:3838/Enrichtool2.3/
GSVA不用再多说了吧，花很多篇幅说过了：
GSEA的内容也是更过的：
正餐
保姆级教程 《手把手教你做单细胞测序数据分析》（七）—— 基因集富集分析
（B站同步播出，先看一遍视频再跟着代码一起操作，建议每个视频至少看三遍）
欢迎关注同名公众号~
