免疫组化加生信分析验证基于PD-L2的免疫特征可作为抗PD-1治

2022-08-29  本文已影响0人  生信学霸

PD-L2 based immune signature confers poor prognosis in HNSCC

基于PD-L2的免疫特征赋予HNSCC较差的预后

发表期刊:Oncoimmunology

发表日期:2021 Aug 4

影响因子:8.110

DOI:  10.1080/2162402X.2021.1947569

一、背景

        2018年全球有超过80万个头颈部肿瘤新病例的报道。每年有超过40万患者死于该疾病,其中约90%的患者为头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)亚型。约19-46%的HNSCC患者被诊断为淋巴结转移,15-50%的患者在接受标准护理治疗后出现肿瘤复发。

        越来越多的证据表明,人类癌症(包括晚期HNSCC)的肿瘤微环境中存在免疫失调。PD-1,也被称为CD279,是一种重要的免疫抑制检查点分子,主要表达于活化的B细胞、NK细胞、T细胞和APCs。通过靶向PD-1/PD-L1轴阻断免疫检查点可以改善复发性/转移性(R/M)HNSCC患者的生存率。PD-L2是PD-1的另一个配体,在某些功能上与PD-L1相似,主要影响调节性T细胞。

二、材料与方法

1.数据来源

1)59名接受手术的HNSCC患者

2)HNSCC标本:包括61个原发性HNSCC组织、8个转移性HNSCC组织和11个正常舌组织

2.实验流程

1)免疫组化中的样品去糖基化

2)生存树分析模型:使用最小深度和可变重要性(VIMP)建立了生存树分析(STA)模型;采用Kaplan-Meier分析法对结点进行评估

3)体内异种移植肿瘤模式:小鼠实验

4)循环肿瘤细胞的分离、TILs的分离和分析

5)单细胞测序:GSE163872

6)通路分析和基因组富集分析:基因组富集分析(GSEA)用于分析scRNA-seq数据

7)统计学分析:采用Mann-Whitney U检验或Wilcoxon配对t检验、McNemar或chi-squared检验和ANOVA检验进行分析;多变量Cox回归模型和Kaplan-Meier分析被用来评估生存率

三、实验结果

01、PD-L2在大多数HNSCC患者中都有表达

        研究共纳入59名HNSCC患者,大多数患者是男性(69.49%)和吸烟者(61.02%),其中28例口腔原发性肿瘤。记录了48例(81.4%)死亡,中位随访时间为45个月。所有肿瘤标本用于分析PD-L2和PD-L1表达的患者在诊断时均接受手术,未接受任何新辅助治疗,包括化疗或放疗。

        IHC染色显示PD-L2在大多数肿瘤中表达(图1a),此外,PD-L2水平与AJCC分期密切相关(图1b)。与非转移性肿瘤相比,淋巴结转移性肿瘤样本中的瘤内PD-L2+细胞密度明显较高(图1c)。59份标本中有15份检测到PD-L1的表达,PD-L1阳性肿瘤细胞的染色密度和强度明显弱于PD-L2阳性肿瘤细胞,肿瘤中PD-L1和PD-L2的表达密切相关。此外,61.36%的肿瘤标本在PD-L1阴性的样本中为PD-L2阳性(图1d)。与只表达PD-L1的标本相比,同时表达PD-L2和PD-L1的标本以及只表达PD-L2的标本更为常见。这些结果表明,HNSCC样本的瘤内PD-L2水平高于PD-L1,表明在没有PD-L1的情况下,PD-L2在免疫抑制中起着代偿作用。

        43个HNSCC标本在基质中呈PD-L2阳性。肿瘤中PD-L2阳性细胞的密度高于基质中的密度,但是差异没有统计学意义(图1e)。另外,PD-L1在基质中的表达也没有统计学意义。肿瘤表达PD-L1和PD-L2在基质中的表达强度没有关联。

        作者进一步验证了PD-L2在HNSCC标本中的表达(图1f),其中包括61个原发性HNSCC组织、8个转移性HNSCC组织和11个正常舌组织。86.96%的肿瘤标本为PD-L2阳性,与原发肿瘤和非肿瘤组织相比,转移性肿瘤表现出更高的PD-L2水平(图1g)。

图1 PD-L2在HNSCC标本中的表达和分布

02、HNSCC标本的PD-L2表达和临床病理学特征

        PD-L2的表达与淋巴结转移、AJCC分期和分化等级成正相关。在单变量分析中,原发部位、淋巴结转移、分化等级和临床分期(AJCC 2018)、瘤内PD-L2、CD3、CD8和基质CD3与预后不良有关。62.5%的肿瘤在淋巴结转移的患者中显示中度或高度的PD-L2染色。PD-L2和CD8的状态是肿瘤的独立预后因素。

03、PD-1的表达与PD-L2的表达有关

        PD-L2通过与PD-1阳性TILs结合,在HNSCC的免疫逃逸中起着重要作用。38.98%的肿瘤标本为PD-1阳性TILs。PD-1阳性细胞显示出较高的CD8表达水平,PD-1+TILs与CD8+TILs呈正相关(图2a)。值得注意的是,PD-1+TILs的中位数与PD-L2表达强度呈正相关(图2b)。

        观察到四种不同的肿瘤微环境:I型为适应性免疫抵抗,32%,有TIL和PD-L1表达的病例中观察到;II型为免疫忽视 ,22%,同时缺乏TIL、PD-L1或PD-L2的病例中观察到;III型为内在诱导,39%,有PD-L1和PD-L2表达且TIL缺乏的病例中观察到;IV型,耐受,7%,有TIL且缺乏PD-L1表达的病例中观察到(图2c)。此外,还经常观察到PD-L2和PD-1的存在而PD-L1的缺失(图2d)。

图2 HNSCC中PD-1、PD-L1和PD-L2表达的异质性

04、PD-L2在小鼠异种移植肿瘤模型的免疫抑制中起关键作用

        作者建立了一个C3H免疫能力小鼠模型,并研究了PD-L2在PD-L1存在的情况下的潜在作用(图3a)。PD-1或PD-L2的单克隆抗体(mAb)表现出明显的抗肿瘤作用,而PD-L1 mAb对肿瘤生长的抑制作用有限(图3b, c)。PD-L2 mAb组的TILs中活化的CD8+IFN-γ+ T细胞数量是PD-L1 mAb组的两倍(图3d)。在CD335+NK和NK1.1+NKT细胞数量中也发现类似的模式(图3e,f)。与PD-L1 mAb组相比,PD-L2 mAb组的细胞毒性T细胞活性升高,如粒酶B的免疫染色所示(图3g)。这些结果表明,用PD-1或PD-L2的mAb治疗可以极大地诱导免疫细胞在肿瘤中的浸润。此外,代表肿瘤高转移能力的CTCs在PD-1 mAb和PD-L2mAb组都明显减少(图3h)。

图3 PD-L2在体内的免疫抑制中起着决定性作用

        随着上述PD-L2在HNSCC中的抗肿瘤免疫作用的证明,作者进一步研究了免疫相关基因的表达与PD-L2之间的相关性(图4a)。在肿瘤体中,CD8+T细胞、CD3+T细胞和FOXP3+Tregs的密度大大低于基质中的密度(图4b)。在瘤内和基质区域,CD8+或CD3+T细胞的数量明显高于FOXP3+ Tregs的数量(图4b)。FOXP3+Tregs、CD3+T细胞和CD8+T细胞的数量在肿瘤体中呈正相关(图4c)。在肿瘤体中,PD-L2+肿瘤细胞的密度与CD3+T细胞、CD8+T细胞、FOXP3+Tregs(图4d)之间有正相关关系。然而,基质PD-L2与CD3、CD8和FOXP3之间没有明显关联。因此,PD-L2与肿瘤细胞中免疫相关基因的表达密切相关。

图4 HNSCC的免疫标志物表达

05、预测HNSCC的OS的预测模型

        作者验证了瘤内PD-L2的高表达具有较短的OS(图5a)。样本根据CD3(图4e)、CD8(图4e)和FOXP3(图4e)的表达被分为两组,与OS没有直接关系。作者假设免疫细胞可能由于肿瘤和基质的表达而对OS产生不同的影响。数据显示,CD3、PD-1和CD8的表达至少部分参与了OS(图5a)。评估具有不同生物标志物表达的T细胞亚群可能是预测HNSCC OS的更准确的预后标志。为了选择与生存有关的变量,本研究STA模型中包括了瘤内PD-L2和瘤内/基质CD3、PD-1、FOXP3和CD8的表达。

        作者发现瘤内CD3、CD8和PD-1水平对OS有明显影响。PD-L2是重要性分析中最具影响力的变量。虽然基质PD-1、基质CD8以及瘤内和基质FOXP3水平的VIMP评分为-0.0013、-0.0022、0.0011和-0.0026,但它们的最大值都比最小深度的临界值(0.9308)高;因此,它们被排除在STA模型之外(图5b)。

        本研究确定了六个节点,可以描述HNSCC或目前队列中的预后特征。携带瘤内PD-L2低基质CD3高的患者的预后标志与72个月的最佳中位OS有关,而最差的生存发生在第4个节点,中位OS为10个月(瘤内PD-L2高瘤内CD3低瘤内CD8低)(图5c)。值得注意的是,与瘤内PD-L2高瘤内CD3低瘤内CD8低特征的患者相比,瘤内PD-L2低基质CD3高特征的患者的预后指数预测的OS更长(图5d)。

图5 基于PD-L2的免疫特征与HNSCC患者的生存期有关

06、PD-L2与细胞因子IL-6有关

        为了研究PD-L2与其他因素之间的关联,作者使用scRNA-seq分析了来自两名HNSCC患者的PD-L2的表达(图6a)。根据细胞的全局表达模式将其划分为初步的集群,并通过特定的标记基因将集群注释为癌细胞、肌细胞、癌症相关的成纤维细胞、正常成纤维细胞、内皮细胞和免疫细胞。为了更好地分析癌细胞的异质性,作者进一步确定了癌细胞集群的子集群,癌细胞被进一步划分为六个集群,发现表达PD-L2高表达的细胞在集群2中被富集(图6b)。

        为了进一步了解PD-L2表达在临床中的作用,首先使用似然比检验来确定与其他集群相比,PD-L2富集的集群2中的差异表达基因(DEGs),确定了819个上调的DEGs,发现在这819个DEGs中包含了几个与预后不良有关的基因。根据GSEA分析,PD-L2高表达的相关特征在 "HALLMARK_HYPOXIA"、"HALLMARK_INFLAMMATORY_RESPONSE "和"HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA_NFKB "组中富集。为了证实这一结果,进行了GSVA分析,以估计和比较每个簇的癌症标志相关状态。与其他集群相比,集群2显示属于 "HALLMARK_EPITHELIAL_MESENCHYMAL_TRANSITION"、"HALLMARK_HYPOXIA "和"HALLMARK_INFLAMMATORY_RESPONSE "组的基因表达较高(图6c)。特别是与Th2细胞因子反应有关的IL-6被确认为重叠基因,表明它与PD-L2高表达有关(图6d)。

        为了进一步验证PD-L2和IL-6之间的潜在相互作用,作者对59个人类HNSCC样本进行了IHC。共有59.32%的HNSCC标本为IL-6阳性,包括27.12%的弱染色,20.34%的中度染色和11.86%的强染色(图6e)。IL-6高表达的患者OS较差(图6f),IL-6水平与PD-L2水平呈正相关(图6g)。

        作者进一步调查了它与FOXP3、CD8和CD3的相关性,发现IL-6的表达与肿瘤中的CD8细胞呈正相关(图6g),提示PD-L2水平高的患者的生存不良是由较高的IL-6分泌引起。为了进一步验证这一假设,作者评估了PD-L2在体外对IL-6刺激的表达。PD-L2的mRNA和蛋白水平都因IL-6处理而明显升高(图6h,i)。这些结果表明,TH2相关的细胞因子IL-6有助于HNSCC中PD-L2的异常表达。

图6 PD-L2的表达与细胞因子IL-6的表达有关

四、结论

        作者定义了一个基于PD-L2的免疫特征,可以在HNSCC患者的队列中区分HNSCC的不同亚型的生存结果。强调PD-L2是一个很有前途的免疫检查点目标,并证明其在HNSCC中的预后价值。本研究还为在辅助治疗中使用抗IL6疗法提供了依据,以改善PD-L2水平高的HNSCC患者的免疫治疗方法。

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