调控网络的构建-Cytoscape & string

常用的工具
某个基因的研究现状--pubmed文献自动分析工具EVEX数据库
cytoscape的插件
参考链接
string
string教程

Cytoscape的使用

Cytoscape官网
cytoscape中文教程-Y大宽
Cytoscape是一个基于Java的网络构建程序，在它的基础上有许多现成的可用的包，用于网络构建等等。官网包括软件下载，软件依赖检测，相关社区，相关包cytoscape的所有插件包，教程。
主要汉化讲述：差异基因的网络构建
从APPs—— APP manager …… 从中输入目标包STRING,install
同样安装其他的包
Agilent Literature Search,GeneMANIA,
WikiPathways
NDEx
GeneMANIA
也可以从上述地址下载jar文件，手动从APP manager里面安装。

默认的物种是人类，需要根据自己的实际物种修改。