满足你的硕士毕业论文小套路---蛋白结构与功能和疾病关系的生信分

     目前，许多学校的硕士毕业论文要求都是发表一篇中文核心论文，便能达到毕业小论文考核。针对小论文的发表，有的同学要么是因为课题难度有些大，没有摸好合适的浓度，实验结果不理想。有的要么是课题方向有错误，不好调整。有的，可能是想憋一篇SCI高分，觉得中文核心论文档次太low，不想发表。不同的同学有不同的原因。但不管何种原因，咱心心念念的不延毕的梦想一定要实现，否则昨天小师妹，今天变成同门。课题组的大师兄大师姐的称呼又得持续一年，老师实时@的人都是你，这想着是不是就有点后背发凉。                        有的同学可能会问，那实验结果不理想，生信分析R语言、Linux等感觉非常有难度的东西我都不会，那我能怎么办。那今天我就来给大家分享一个小技巧，利用现在十分发达的生信数据库，如果你能耐下心来，专注写文章，三天之内就能完成你撰写文章的想法。为什么说是撰写而不说是发表呢？实话实说，随着目前简单生信分析套路比较普遍且为纯生信分析，发表还需要看运气。倘若是以前，貌似是写了只要遵守杂志社的要求，文章具有一定意义，就能完成发表。如果想试试的同学，完全可以试一试。毕竟才几天，学习一种套路，对于自身对基础科研关于目的基因或者蛋白的在线数据库的使用以及下游分析与认知都有一定提升，何乐而不为呢？好了，说了这么多，咱们开始正文讲述吧。                                                                                                    对于基因或者蛋白结构与功能的分析以及其与某种疾病的关系类的生信分析，咱们首先肯定得先找到一个基因。那如何找到一个基因呢？咱们可以通过组学测序中正常组与实验组显著的差异基因去猜想某个基因可能作为影响疾病的基因。或者，咱们可以通过看看文章讨论中，作者猜想的可能影响疾病的基因作为目的基因。这都希望该文章的影响因子越高越好。目的基因确定后，咱们就可以上Uniport网站寻该蛋白质人种属的序列。得到蛋白质的序列之后，咱们可以利用其序列分析其结构。结构上可以在Uniport上看看其氨基酸的组成，利用DNAMA8.0比较几种不同种属目的蛋白质的同源性；通过Prot Param（https://web.expasy.org/）分析该蛋白质的理化性质、相对分子质量预测、等电点等；采用ProtScale分析蛋白质的亲疏水性；通过SinalP 5.0 (http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/index.php)预测其信号肽；结构上，利用TMHMM（http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/）分析其跨膜结构；采用SOMPA（http://npsa-pbil.ibcp）分析其二级结构，通过SWISSMODEL(https://swissmodel.expasy.org/)建模分析其三级结构。功能上，通过NetPhos 3.1 Server（http://www.cbs.dtu.dk/）进行翻译后磷酸化位点修饰预测；通过String（https://string-db.org/）进行蛋白互作分析，通过Quick GO（https://www.ebi.ac.uk/QuickGO/）进行基因本体论分析。意味着只要你确定了目的基因，后续你文章的作图信息，你只需要查阅一下相应的数据库，便能快速出文章图，快的话一个小时以内肯定能够完成。结果部分，基本就可以填充。                                               这种类型的文章一定程度对于你关于讨论的书写要求比较高，而写讨论很常规的一种写法就是要利用好你的目标蛋白的互作蛋白分析（PPI）以及其与磷酸化分析的结果，讲述其互作蛋白与磷酸化激酶和目标蛋白对于疾病可能存在的关系。利用已经发表的文献去查询每一个互作蛋白与激酶和疾病的关系，然后把目的蛋白与其连接，描述其潜在的关系，去讲述好这个故事。整体一篇可能成为核心论文的论文就生成了，当然为提高的文章录用，你可以加一些比较简单的细胞或者组织关于目的蛋白qPCR实验。那可能能提高不少的概率。当然，文章具体上述的结果图你也可以相应更改，别让编辑觉得我们好像在哪见过。蛋白结构与功能的其他公共实验数据库你也可以搜索，做一些更改，一切为了录用的更加顺利。更多的分享的是一种在线数据库利用的思想，对于目前课题的蛋白你也可以通过这些查询进一步了解。当然，让咱们在毕业前，内心无压力，不用担心延毕，以及让咱们在毕业时，能够身着蓝袍，头戴深蓝色流苏冒也异常重要。Go ahead！！！