centos安装hdf5及安装R包hdf5r
2024-04-21 本文已影响0人
expgene
探序基因肿瘤研究院 整理
yum install hdf5-devel,提示:
问题: 冲突的请求
- nothing provides libaec-devel(x86-64) needed by hdf5-devel-1.10.5-4.el8.x86_64 from epel
(尝试添加 '--skip-broken' 来跳过无法安装的软件包 或 '--nobest' 来不只使用软件包的最佳候选)
于是自己下载源代码编译:
https://support.hdfgroup.org/ftp/HDF5/releases/hdf5-1.10/hdf5-1.10.5/src/hdf5-1.10.5.tar.gz
解压缩后,./configure--prefix=/usr/local/hdf5,make,make install
在R中,
install.packages("hdf5r",configure.args="--with-hdf5=/usr/local/hdf5/bin/h5cc")
参考: