基因家族分析 | 番茄Nramp基因家族分析（二）
2019-05-08 本文已影响2人
pomela
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基因家族分析 | 番茄Nramp基因家族分析（一）
基因家族分析 | 番茄Nramp基因家族分析（二）
通过上一部分的分析得到了以下数据：
id.txt
Nramp_cds.fasta
nramp_protein.fasta
gene.bed
gene_seq.fasta
接下来利用获得的这些数据进行可视化。
1.motif分析
meme: http://meme-suite.org/tools/meme；方法参见 MEME在线网站查找motif步骤
meme得到的motif结果
下载xml文件（meme和mast两个结果）,放到TBtools中去，结果漂亮一些
nramp_protein_meme.xml
nramp_protein_mast.xml
TBtools得到的结果
2.基因结构，同样适用TBtools
基因结构
3.构树
TBtools合并以上三个分析：
参考：
01 MEME在线网站查找motif步骤
02 [软件使用] 使用TBtools重新绘制MEME motif图http://www.omicshare.com/forum/forum.php?mod=viewthread&tid=2312&highlight=MEME
03 TBtools基因家族分析详细教程(2)基因家族成员的基本分析
