模型不如意十之八九，可拿出手无二三
2020-09-22 本文已影响0人
小洁忘了怎么分身
今天又来开放性讨论啦。
最近做了一个TCGA的数据分析，走到最后多因素cox模型构建这一步了，选择了三个基因，对数据集划分了高低风险，C-index值和timeROC计算的AUC值都还看得过去，but，就训练集的高低风险KM-plot出现了如此哭笑不得的交叉？（连测试机都没交叉，怎么训练集还叉上了）
疾病是乳腺癌，横坐标是月
我发朋友圈问研究肿瘤的医学生们，模型成这种情况，是否可以使用？没想到这个问题很多人感触颇深，戳中了痛点：怎么看自己的模型，都是歪瓜裂枣，要么C-index值不够美丽，要么AUC值凄凄惨惨，要么就不稳定，训练集壮得像头牛，跑到测试集立刻痛哭流涕。
还有人晒出了寄几的同款图
以及已发表文章里那蜿蜒曲折的交叉？？？
看来我提的还是一个比较痛点的问题吧，在朋友圈和几个群里发出去，有幸收到了三五十条回复，我把讨论结果跟大家分享一下，总共有以下几个观点：
- 可以使用，因为p值小于0.05，并且趋势是对的。
- 不能使用km plot，因为出现了交叉，不适合使用km plot。
- 交叉点在100个月以后，所以可以只讨论5年内或者8年内的，不考虑生存时间超长的那些病人（建模时去掉他们）。
- 可以分段讨论，说明一下为什么出现了交叉，我看到比较有说服力的理由是，可能因为过了100个月后，样本的数量太少，导致比例变化大，不具有代表性了。
还想问一下，这一张，一小点的交叉，是否可能会被卡呢，要如何解释一下才好？
疾病是乳腺癌，横坐标是月
我来发个投票和讨论，欢迎并感谢大家发表自己的见解~
